RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491937.5

RPS7-209, Transcript of ribosomal protein S7, human

TSL 2

Gene RPS7, Length 987 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS7-209	ENST00000491937	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		32.81	■■■□□ 2.84
RPS7-209	ENST00000491937	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		32.81	■■■□□ 2.84
RPS7-209	ENST00000491937	CENPF	P49454	3210 aa		32.8	■■■□□ 2.84
RPS7-209	ENST00000491937	CAP1	Q01518	475 aa		32.8	■■■□□ 2.84
RPS7-209	ENST00000491937	SNAPC2	Q13487	334 aa		32.8	■■■□□ 2.84
RPS7-209	ENST00000491937	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		32.8	■■■□□ 2.84
RPS7-209	ENST00000491937	FAM151A	Q8WW52	585 aa		32.8	■■■□□ 2.84
RPS7-209	ENST00000491937	ARMC5	Q96C12	935 aa		32.8	■■■□□ 2.84
RPS7-209	ENST00000491937	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	32.8	■■■□□ 2.84
RPS7-209	ENST00000491937	IRF6	O14896	467 aa		32.79	■■■□□ 2.84
RPS7-209	ENST00000491937	PRDX5	P30044	214 aa		32.79	■■■□□ 2.84
RPS7-209	ENST00000491937	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	32.79	■■■□□ 2.84
RPS7-209	ENST00000491937	PPIL2	Q13356	520 aa		32.79	■■■□□ 2.84
RPS7-209	ENST00000491937	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
RPS7-209	ENST00000491937	POTEF	A5A3E0	1075 aa		32.78	■■■□□ 2.84
RPS7-209	ENST00000491937	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		32.78	■■■□□ 2.84
RPS7-209	ENST00000491937	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
RPS7-209	ENST00000491937	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	32.77	■■■□□ 2.84
RPS7-209	ENST00000491937	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		32.77	■■■□□ 2.84
RPS7-209	ENST00000491937	SEMA3E	O15041	775 aa		32.76	■■■□□ 2.83
RPS7-209	ENST00000491937	TCP10	Q12799	353 aa		32.76	■■■□□ 2.83
RPS7-209	ENST00000491937	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		32.76	■■■□□ 2.83
RPS7-209	ENST00000491937	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	32.76	■■■□□ 2.83
RPS7-209	ENST00000491937	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		32.76	■■■□□ 2.83
RPS7-209	ENST00000491937	BTBD19	C9JJ37	291 aa		32.75	■■■□□ 2.83
RPS7-209	ENST00000491937	PPAT	Q06203	517 aa		32.75	■■■□□ 2.83
RPS7-209	ENST00000491937	TLR2	O60603	784 aa		32.74	■■■□□ 2.83
RPS7-209	ENST00000491937	INPP5B	P32019	993 aa		32.74	■■■□□ 2.83
RPS7-209	ENST00000491937	PHKA1	P46020	1223 aa		32.74	■■■□□ 2.83
RPS7-209	ENST00000491937	NFIA	Q12857	509 aa		32.74	■■■□□ 2.83
RPS7-209	ENST00000491937	COPRS	Q9NQ92	184 aa		32.74	■■■□□ 2.83
RPS7-209	ENST00000491937	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	32.73	■■■□□ 2.83
RPS7-209	ENST00000491937	MEIS3	Q99687	375 aa		32.73	■■■□□ 2.83
RPS7-209	ENST00000491937	USP40	Q9NVE5	1235 aa		32.72	■■■□□ 2.83
RPS7-209	ENST00000491937	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	32.71	■■■□□ 2.83
RPS7-209	ENST00000491937	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		32.71	■■■□□ 2.83
RPS7-209	ENST00000491937	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		32.71	■■■□□ 2.83
RPS7-209	ENST00000491937	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		32.71	■■■□□ 2.83
RPS7-209	ENST00000491937	AK9	Q5TCS8	1911 aa		32.71	■■■□□ 2.83
RPS7-209	ENST00000491937	ADORA1	P30542	326 aa		32.7	■■■□□ 2.83
RPS7-209	ENST00000491937	KIF22	Q14807	665 aa		32.7	■■■□□ 2.83
RPS7-209	ENST00000491937	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		32.7	■■■□□ 2.83
RPS7-209	ENST00000491937	CCDC102B	Q68D86	513 aa		32.7	■■■□□ 2.83
RPS7-209	ENST00000491937	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	32.7	■■■□□ 2.83
RPS7-209	ENST00000491937	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	32.7	■■■□□ 2.83
RPS7-209	ENST00000491937	ZNF333	Q96JL9	665 aa		32.7	■■■□□ 2.83
RPS7-209	ENST00000491937	ZBTB22	O15209	634 aa		32.69	■■■□□ 2.82
RPS7-209	ENST00000491937	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	32.69	■■■□□ 2.82
RPS7-209	ENST00000491937	NBPF11	Q86T75	865 aa		32.69	■■■□□ 2.82
RPS7-209	ENST00000491937	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	32.68	■■■□□ 2.82
RPS7-209	ENST00000491937	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		32.68	■■■□□ 2.82
RPS7-209	ENST00000491937	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
RPS7-209	ENST00000491937	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		32.67	■■■□□ 2.82
RPS7-209	ENST00000491937	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		32.67	■■■□□ 2.82
RPS7-209	ENST00000491937	BRCA2	P51587	3418 aa		32.66	■■■□□ 2.82
RPS7-209	ENST00000491937	GNAI3	P08754	354 aa		32.66	■■■□□ 2.82
RPS7-209	ENST00000491937	RASGRF1	Q13972	1273 aa		32.66	■■■□□ 2.82
RPS7-209	ENST00000491937	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		32.66	■■■□□ 2.82
RPS7-209	ENST00000491937	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		32.66	■■■□□ 2.82
RPS7-209	ENST00000491937	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
RPS7-209	ENST00000491937	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
RPS7-209	ENST00000491937	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
RPS7-209	ENST00000491937	CCER2	I3L3R5	266 aa		32.64	■■■□□ 2.82
RPS7-209	ENST00000491937	GAK	O14976	1311 aa		32.64	■■■□□ 2.82
RPS7-209	ENST00000491937	SRGAP3	O43295	1099 aa		32.64	■■■□□ 2.82
RPS7-209	ENST00000491937	GNRH1	P01148	92 aa		32.64	■■■□□ 2.82
RPS7-209	ENST00000491937	RGS3	P49796	1198 aa		32.64	■■■□□ 2.82
RPS7-209	ENST00000491937	TIMM10	P62072	90 aa		32.64	■■■□□ 2.82
RPS7-209	ENST00000491937	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		32.64	■■■□□ 2.82
RPS7-209	ENST00000491937	ABCF2	Q9UG63	623 aa		32.64	■■■□□ 2.82
RPS7-209	ENST00000491937	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		32.63	■■■□□ 2.81
RPS7-209	ENST00000491937	PDHX	O00330	501 aa		32.63	■■■□□ 2.81
RPS7-209	ENST00000491937	ENTPD3	O75355	529 aa		32.63	■■■□□ 2.81
RPS7-209	ENST00000491937	SLF2	Q8IX21	1173 aa		32.63	■■■□□ 2.81
RPS7-209	ENST00000491937	IDI2	Q9BXS1	227 aa		32.63	■■■□□ 2.81
RPS7-209	ENST00000491937	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		32.63	■■■□□ 2.81
RPS7-209	ENST00000491937	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		32.63	■■■□□ 2.81
RPS7-209	ENST00000491937		A0A1B0GUL7	405 aa		32.62	■■■□□ 2.81
RPS7-209	ENST00000491937	MTX1	Q13505	466 aa		32.62	■■■□□ 2.81
RPS7-209	ENST00000491937	C17orf99	Q6UX52	265 aa		32.62	■■■□□ 2.81
RPS7-209	ENST00000491937	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		32.61	■■■□□ 2.81
RPS7-209	ENST00000491937	TFCP2	Q12800	502 aa		32.61	■■■□□ 2.81
RPS7-209	ENST00000491937	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
RPS7-209	ENST00000491937	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
RPS7-209	ENST00000491937	CPA4	Q9UI42	421 aa		32.61	■■■□□ 2.81
RPS7-209	ENST00000491937	DOCK2	Q92608	1830 aa		32.61	■■■□□ 2.81
RPS7-209	ENST00000491937	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		32.6	■■■□□ 2.81
RPS7-209	ENST00000491937	PRMT2	P55345	433 aa		32.6	■■■□□ 2.81
RPS7-209	ENST00000491937	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		32.6	■■■□□ 2.81
RPS7-209	ENST00000491937	GCC1	Q96CN9	775 aa		32.6	■■■□□ 2.81
RPS7-209	ENST00000491937	XAGE2	Q96GT9	111 aa		32.6	■■■□□ 2.81
RPS7-209	ENST00000491937	MOGS	Q13724	837 aa		32.59	■■■□□ 2.81
RPS7-209	ENST00000491937	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	32.59	■■■□□ 2.81
RPS7-209	ENST00000491937	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		32.59	■■■□□ 2.81
RPS7-209	ENST00000491937	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		32.58	■■■□□ 2.81
RPS7-209	ENST00000491937	CXCL11	O14625	94 aa		32.58	■■■□□ 2.81
RPS7-209	ENST00000491937	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		32.58	■■■□□ 2.81
RPS7-209	ENST00000491937	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
RPS7-209	ENST00000491937	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.8
RPS7-209	ENST00000491937	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8

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