RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435348.5

TTC28-AS1-214, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 578 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-214ENST00000435348 TSPYL4Q9UJ04 414 aa12.95□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ZNF609O15014 1411 aa12.95□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SCN9AQ15858 1988 aa12.94□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 USP17L3A6NCW0 530 aa12.94□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 USP17L4A6NCW7 530 aa12.94□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ANXA1P04083 346 aa12.94□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 RPS8P62241 208 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 USP17L1Q7RTZ2 530 aa12.94□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CYP4X1Q8N118 509 aa12.94□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 XAGE3Q8WTP9 111 aa12.94□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 NLRP7Q8WX94 980 aa12.94□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SLC10A4Q96EP9 437 aa12.94□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 H0YGN5 161 aa12.93□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 NBPF9Q3BBW0 867 aa12.93□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa12.93□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa12.93□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CLSPNQ9HAW4 1339 aa12.92□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SP3Q02447 781 aa12.92□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PROSER3Q2NL68 480 aa12.92□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 FAM89AQ96GI7 184 aa12.92□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PODXL2Q9NZ53 605 aa12.92□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 DLG5Q8TDM6 1919 aa12.92□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PSME4Q14997 1843 aa12.91□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 LRP10Q7Z4F1 713 aa12.91□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PODNQ7Z5L7 613 aa12.91□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 DPF3Q92784 378 aa12.91□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 MYO3BQ8WXR4 1341 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 WNT10BO00744 389 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 MYCP01106 439 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CTC1Q2NKJ3 1217 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 RDH13Q8NBN7 331 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ZNF333Q96JL9 665 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 GMLQ99445 158 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-214ENST00000435348 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ATP2B4P23634 1241 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CRHR2Q13324 411 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 HIC1Q14526 733 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 LDLRAD1Q5T700 205 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 WNK4Q96J92 1243 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 XDHP47989 1333 aa12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SASH1O94885 1247 aa12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 MMP14P50281 582 aa12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 NFE2L2Q16236 605 aa12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 HTTP42858 3142 aa12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 DDX11L8A8MPP1 907 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 GPR37O15354 613 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CCDC152Q4G0S7 254 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 BRICD5Q6PL45 260 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PLBD2Q8NHP8 589 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PCGF6Q9BYE7 350 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CENPFP49454 3210 aa12.86□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SMPD1P17405 629 aa12.86□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 IREB2P48200 963 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 KIF22Q14807 665 aa12.86□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa12.86□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa12.86□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PHOX2BQ99453 314 aa12.86□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 HTATIP2Q9BUP3 242 aa12.86□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SEC31BQ9NQW1 1179 aa12.86□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 FZD1Q9UP38 647 aa12.86□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PPP2R1AP30153 589 aa12.85□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 GCGRP47871 477 aa12.85□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ISCA1Q9BUE6 129 aa12.85□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 MXD3Q9BW11 206 aa12.85□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 COL4A1P02462 1669 aa12.85□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 UNCXA6NJT0 531 aa12.84□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 WIPF1O43516 503 aa12.84□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 MYO1BO43795 1136 aa12.84□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 MAP3K11Q16584 847 aa12.84□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa12.84□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 DACT2Q5SW24 774 aa12.84□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 STRIP1Q5VSL9 837 aa12.84□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CLMNQ96JQ2 1002 aa12.84□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 DEFB129Q9H1M3 183 aa12.84□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa12.84□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 CHPF2Q9P2E5 772 aa12.84□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa12.84□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-214ENST00000435348 NR2E3Q9Y5X4 410 aa12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms