RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427658.1

AFG3L1P-208, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,758 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FCHSD2	O94868	740 aa		11.97	□□□□□ -0.49
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IL13	P35225	146 aa		11.97	□□□□□ -0.49
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		11.97	□□□□□ -0.49
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NBPF3	Q9H094	633 aa		11.97	□□□□□ -0.49
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		11.97	□□□□□ -0.49
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		11.97	□□□□□ -0.49
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		11.96	□□□□□ -0.49
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		11.96	□□□□□ -0.49
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		11.96	□□□□□ -0.49
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SH3GL3	Q99963	347 aa		11.96	□□□□□ -0.49
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SAMM50	Q9Y512	469 aa		11.96	□□□□□ -0.49
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CPD	O75976	1380 aa		11.96	□□□□□ -0.49
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		11.96	□□□□□ -0.49
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	11.96	□□□□□ -0.49
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PTPN21	Q16825	1174 aa		11.96	□□□□□ -0.49
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM139	Q8IV31	216 aa		11.96	□□□□□ -0.49
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARHGAP6	O43182	974 aa		11.96	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AP1G2	O75843	785 aa		11.96	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FANCC	Q00597	558 aa		11.96	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		11.96	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FSBP	O95073	299 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GC	P02774	474 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NCAPD2	Q15021	1401 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NFE2L2	Q16236	605 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CEP112	Q8N8E3	955 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KLC4	Q9NSK0	619 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658		A0A1B0GUA9	196 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ATP1A3	P13637	1013 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NCAPH	Q15003	741 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DPF2	Q92785	391 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GBP3	Q9H0R5	595 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		11.95	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF202	O95125	648 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HOXC9	P31274	260 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GCK	P35557	465 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	REST	Q13127	1097 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM210A	Q96ND0	272 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CDC23	Q9UJX2	597 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CFAP45	Q9UL16	551 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SHTN1	A0MZ66	631 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CEP57	Q86XR8	500 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	11.94	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		11.94	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RWDD2B	P57060	319 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PTH1R	Q03431	593 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IP6K1	Q92551	441 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SDF4	Q9BRK5	362 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UBASH3A	P57075	661 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CENPH	Q9H3R5	247 aa		11.93	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SNX1	Q13596	522 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NAA25	Q14CX7	972 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DESI2	Q9BSY9	194 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BIN1	O00499	593 aa		11.92	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	11.92	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GGCX	P38435	758 aa		11.92	□□□□□ -0.5

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