RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 DNAJC25Q9H1X3 360 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 C1GALT1Q9NS00 363 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 ITGB5P18084 799 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 ORC1Q13415 861 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 COL19A1Q14993 1142 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 ABCB6Q9NP58 842 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 OGFOD3Q6PK18 319 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 FLCNQ8NFG4 579 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 IGHA2P01877 340 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 PDE3AQ14432 1141 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 ASIC4Q96FT7 647 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRK-202ENST00000368205 TMPRSS2O15393 492 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 CCDC74AQ96AQ1 378 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 CRIM1Q9NZV1 1036 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 TRAK1Q9UPV9 953 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 GPR182O15218 404 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 CYP27C1Q4G0S4 372 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 OGFOD2Q6N063 350 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 TXNDC2Q86VQ3 553 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 STK11IPQ8N1F8 1099 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 KRT82Q9NSB4 513 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 SLC5A6Q9Y289 635 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 FAAP100Q0VG06 881 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 WFDC3Q8IUB2 231 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 GLIS3Q8NEA6 775 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 MISP3Q96FF7 219 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 ATXN3LQ9H3M9 355 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 SLFN14P0C7P3 912 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 LIG1P18858 919 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP8.04□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 ID3Q02535 119 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 POU5F2Q8N7G0 328 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 DMRTB1Q96MA1 342 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 FANCD2OSQ96PS1 177 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 NIF3L1Q9GZT8 377 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF862O60290 1169 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 FZD5Q13467 585 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 GRM2Q14416 872 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 CSRNP1Q96S65 589 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 RBCK1Q9BYM8 510 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 PIDD1Q9HB75 910 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRK-202ENST00000368205 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 PAPLNO95428 1278 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 SPRED2Q7Z698 418 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 NETO1Q8TDF5 533 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 LGR6Q9HBX8 967 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 DISC1Q9NRI5 854 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 FAM87AP0C7U9 286 aa8□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 PPP2R3AQ06190 1150 aa8□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 CDK5R2Q13319 367 aa8□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 PLCL1Q15111 1095 aa8□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 PDZD3Q86UT5 571 aa8□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 TMC1Q8TDI8 760 aa8□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 MKNK2Q9HBH9 465 aa8□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM39AQ9NV64 488 aa8□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF792Q3KQV3 632 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 DTHD1Q6ZMT9 781 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 BIN1O00499 593 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 TTLL4Q14679 1199 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 PPP4R2Q9NY27 417 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 VAV3Q9UKW4 847 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 C8AP07357 584 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 FUT4P22083 530 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 FCGRTP55899 365 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 JAG1P78504 1218 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 PRKCQQ04759 706 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 NLRP2Q9NX02 1062 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-202ENST00000368205 BNIP3Q12983 259 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 FAM181AQ8N9Y4 354 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 NEFMP07197 916 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 CD8BP10966 210 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 ERVK-24P63145 666 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRK-202ENST00000368205 PDE4CQ08493 712 aa7.95□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms