RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280377.9

USP15-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP15, Length 4,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-201ENST00000280377 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
USP15-201ENST00000280377 GRPEL1Q9HAV7 217 aa6.67□□□□□ -1.34
USP15-201ENST00000280377 UBR3Q6ZT12 1888 aa6.66□□□□□ -1.34
USP15-201ENST00000280377 PTMAP06454 111 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USP15-201ENST00000280377 TDO2P48775 406 aa6.66□□□□□ -1.34
USP15-201ENST00000280377 TTC6Q86TZ1 520 aa6.66□□□□□ -1.34
USP15-201ENST00000280377 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
USP15-201ENST00000280377 PRDM1O75626 825 aa6.66□□□□□ -1.34
USP15-201ENST00000280377 FAM184AQ8NB25 1140 aa6.66□□□□□ -1.34
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USP15-201ENST00000280377 AIFM3Q96NN9 605 aa6.66□□□□□ -1.34
USP15-201ENST00000280377 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USP15-201ENST00000280377 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
USP15-201ENST00000280377 ARAP2Q8WZ64 1704 aa6.66□□□□□ -1.34
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USP15-201ENST00000280377 TRDNQ13061 729 aa6.66□□□□□ -1.34
USP15-201ENST00000280377 MSL1Q68DK7 614 aa6.66□□□□□ -1.34
USP15-201ENST00000280377 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
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USP15-201ENST00000280377 A0A1B0GUL6 1792 aa6.66□□□□□ -1.34
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USP15-201ENST00000280377 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
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USP15-201ENST00000280377 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
USP15-201ENST00000280377 DOCK2Q92608 1830 aa6.65□□□□□ -1.34
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USP15-201ENST00000280377 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa6.65□□□□□ -1.34
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USP15-201ENST00000280377 COL24A1Q17RW2 1714 aa6.65□□□□□ -1.34
USP15-201ENST00000280377 H3BQV1 296 aa6.65□□□□□ -1.35
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USP15-201ENST00000280377 SLC27A3Q5K4L6 730 aa6.65□□□□□ -1.35
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USP15-201ENST00000280377 IRS2Q9Y4H2 1338 aa6.65□□□□□ -1.35
USP15-201ENST00000280377 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa6.65□□□□□ -1.35
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USP15-201ENST00000280377 PTMSP20962 102 aa6.65□□□□□ -1.35
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USP15-201ENST00000280377 USP17L21D6R901 530 aa6.64□□□□□ -1.35
USP15-201ENST00000280377 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
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USP15-201ENST00000280377 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
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USP15-201ENST00000280377 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
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USP15-201ENST00000280377 FBXL16Q8N461 479 aa6.63□□□□□ -1.35
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USP15-201ENST00000280377 KRT85P78386 507 aa6.63□□□□□ -1.35
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USP15-201ENST00000280377 UBE2HP62256 183 aa6.63□□□□□ -1.35
USP15-201ENST00000280377 GIMAP6Q6P9H5 292 aa6.63□□□□□ -1.35
USP15-201ENST00000280377 POTEAQ6S8J7 498 aa6.63□□□□□ -1.35
USP15-201ENST00000280377 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
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