RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 IGHV4-31P0DP07 118 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 COX7CP15954 63 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 FAUP35544 74 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 ERCC8Q13216 396 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 EBI3Q14213 229 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 LGALS9BQ3B8N2 356 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 RFLNAQ6ZTI6 216 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 GTSCR1Q86UQ5 136 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 DRAM1Q8N682 238 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 Q8N976 141 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 WFDC11Q8NEX6 87 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 CMTM2Q8TAZ6 248 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 SMIM4Q8WVI0 70 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF799Q96GE5 643 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 C18orf12Q96KH6 178 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 C2orf50Q96LR7 162 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 PGLYRP2Q96PD5 576 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 SRXN1Q9BYN0 137 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 FAM60AQ9NP50 221 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 CYTL1Q9NRR1 136 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 SLC39A9Q9NUM3 307 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 LINC00527Q9UJ94 153 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 SERP1Q9Y6X1 66 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 QSER1Q2KHR3 1735 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 NUP188Q5SRE5 1749 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 MON2Q7Z3U7 1717 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 RGPD2P0DJD1 1756 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 SCN5AQ14524 2016 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 PATJQ8NI35 1801 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 TRPM7Q96QT4 1865 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 TET3O43151 1660 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 C5P01031 1676 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 PKD1L3Q7Z443 1732 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 PEAK1Q9H792 1746 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 DPRXA6NFQ7 191 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 ZFP92A6NM28 416 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 A8MWL6 223 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 H0Y9J4 135 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 TIMM23O14925 209 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 LINC01565O15544 149 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 SYNGR2O43760 224 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF737O75373 536 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 SCRG1O75711 98 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 NDUFB2O95178 105 aa2.35□□□□□ -2.03
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PTPRM-204ENST00000577468 ZNF286BP0CG31 522 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 COX6A1P12074 109 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 PTHLHP12272 177 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 HLA-DRB4P13762 266 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 VDAC1P21796 283 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 IL3RAP26951 378 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 HLA-DMBP28068 263 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 RPL34P49207 117 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 WFDC2Q14508 124 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 MPV17LQ2QL34 196 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 ETDBQ3ZM63 59 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 NMSQ5H8A3 153 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 DNM1P46Q6ZS02 220 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 Q6ZS49 121 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF101Q8IZC7 436 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM75Q8N9X5 138 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 OR5H2Q8NGV7 314 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 FXYD5Q96DB9 178 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 AMELYQ99218 206 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 C16orf95Q9H693 158 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 MAP6D1Q9H9H5 199 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 PLEKHA3Q9HB20 300 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 CALYQ9NYX4 217 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 ABRACLQ9P1F3 81 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF835Q9Y2P0 537 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 INSL5Q9Y5Q6 135 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 SCN8AQ9UQD0 1980 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 SLIT2O94813 1529 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 SCN2AQ99250 2005 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 NLRC5Q86WI3 1866 aa2.35□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 MIA3Q5JRA6 1907 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRM-204ENST00000577468 UBR1Q8IWV7 1749 aa2.34□□□□□ -2.03
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