RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539962.6

TMOD2-203, Transcript of tropomodulin 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD2, Length 3,000 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2-203ENST00000539962 SLC35E1Q96K37 410 aa5.09□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 C20orf173Q96LM9 149 aa5.09□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 CLEC5AQ9NY25 188 aa5.09□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 DNAH2Q9P225 4427 aa5.09□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 TBC1D24Q9ULP9 559 aa5.09□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 C11orf94C9JXX5 98 aa5.08□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 IFNA4P05014 189 aa5.08□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 C12orf74Q32Q52 190 aa5.08□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 Q6ZTC4 211 aa5.08□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 CENPSQ8N2Z9 138 aa5.08□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 FBXL17Q9UF56 701 aa5.08□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 HLA-DMBP28068 263 aa5.08□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 AMTNQ6UX39 209 aa5.08□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 FOXI2Q6ZQN5 318 aa5.08□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 SLC25A32Q9H2D1 315 aa5.08□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 ZFP92A6NM28 416 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 MED6O75586 246 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 ADAP1O75689 374 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 AMBPP02760 352 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 VAMP1P23763 118 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 GSG1LQ6UXU4 331 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 MAGT1Q9H0U3 335 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 A0A0J9YX75 114 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 NAP1L6A6NFF2 107 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 K7EPK0 472 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 S100A5P33763 92 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 PLP1P60201 277 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 LYZP61626 148 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 RAB11AP62491 216 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 PBDC1Q9BVG4 233 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 C11orf1Q9H5F2 150 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 FLVCR2Q9UPI3 526 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 TRAV10A0A0B4J240 114 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 H3BRN7 92 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 ISLRO14498 428 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 CFDP00746 253 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 HOXB5P09067 269 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 OR2F1Q13607 317 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 C1orf158Q8N1D5 194 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 RNF126Q9BV68 326 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 SCRT1Q9BWW7 348 aa5.07□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 ZNF98A6NK75 572 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 SNRPGP15A8MWD9 76 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 WRBO00258 174 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 CCNKO75909 580 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 FABP1P07148 127 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 TMEM144Q7Z5S9 345 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 SMIM8Q96KF7 97 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 XCL2Q9UBD3 114 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 FNDC10F2Z333 226 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 PLA2G10O15496 165 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 OR4E1P0C645 316 aa5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 SMIM9A6NGZ8 99 aa5.05□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 F6UB75 175 aa5.05□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 IL7P13232 177 aa5.05□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 RPP30P78346 268 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 SPANXN2Q5MJ10 180 aa5.05□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa5.05□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 SLC35B3Q9H1N7 401 aa5.05□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 PKD1P98161 4303 aa5.05□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 A0A087X0K7 114 aa5.05□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 H3BP45 60 aa5.05□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 CRXO43186 299 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 ID1P41134 155 aa5.05□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 MEOX2P50222 304 aa5.05□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 DLK1P80370 383 aa5.05□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 SPANXN5Q5MJ07 72 aa5.05□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 SAMD13Q5VXD3 122 aa5.05□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 PATE2Q6UY27 113 aa5.05□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa5.05□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 MITD1Q8WV92 249 aa5.05□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 PFDN2Q9UHV9 154 aa5.05□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 IGLL5B9A064 214 aa5.05□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 FXYD7P58549 80 aa5.05□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 TAS2R30P59541 319 aa5.05□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 PSG9Q00887 426 aa5.05□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 ARL16Q0P5N6 197 aa5.05□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 OXA1LQ15070 435 aa5.05□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 FAM78BQ5VT40 261 aa5.05□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 OR1B1Q8NGR6 318 aa5.05□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 GPR82Q96P67 336 aa5.05□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
TMOD2-203ENST00000539962 DKK2Q9UBU2 259 aa5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms