RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 OR4C13Q8NGP0 309 aa5.63□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 OR1L8Q8NGR8 309 aa5.63□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa5.62□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 GAGE10A6NGK3 116 aa5.62□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 IGLC2P0DOY2 106 aa5.62□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 IGLC3P0DOY3 106 aa5.62□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 CNTFRP26992 372 aa5.62□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 ERHP84090 104 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 WT1-ASQ06250 92 aa5.62□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 PSG5Q15238 335 aa5.62□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 TMEM155Q4W5P6 130 aa5.62□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 OR5B3Q8NH48 314 aa5.62□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa5.62□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 NDUFA7O95182 113 aa5.62□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 PFN1P07737 140 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 LINC00869P0C866 280 aa5.62□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 PMCHP20382 165 aa5.62□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 TSPOP30536 169 aa5.62□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 LGALS4P56470 323 aa5.62□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 TMEM30BQ3MIR4 351 aa5.62□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 TMEM177Q53S58 311 aa5.62□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 RAB1CQ92928 201 aa5.62□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa5.62□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 BAHCC1Q9P281 2608 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PRD5 423 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PRF3 423 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PRM7 423 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 J3KRW8 73 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 PDE6DO43924 150 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 EFNA4P52798 201 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 ACTL10Q5JWF8 245 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 TMEM133Q9H2Q1 129 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 KCNIP2Q9NS61 270 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 TRAV5A0A0B4J249 113 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 CNIH1O95406 144 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 CRISP2P16562 243 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 USF1P22415 310 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 DLX6P56179 175 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 PRR20EP86478 221 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 PRR20CP86479 221 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 PRR20DP86480 221 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 PRR20BP86481 221 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 PRR20AP86496 221 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 CD69Q07108 199 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 NPIPB3Q92617 1050 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 UHRF2Q96PU4 802 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 SIGMAR1Q99720 223 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 COL12A1Q99715 3063 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 CGB1A6NKQ9 187 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 K7EQM0 130 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 SERF1AO75920 110 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 ESDP10768 282 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 AMTP48728 403 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 PLP1P60201 277 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 ODF1Q14990 250 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 TNXAQ16473 311 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 C2orf83Q53S99 150 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 MORN5Q5VZ52 161 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 OR1B1Q8NGR6 318 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 CITED1Q99966 193 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 CHRDL1Q9BU40 450 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 ONECUT1Q9UBC0 465 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 KAAG1Q9UBP8 84 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa5.6□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 NTF3P20783 257 aa5.6□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 CD24P25063 80 aa5.6□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 VMA21Q3ZAQ7 101 aa5.6□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 PDPNQ86YL7 162 aa5.6□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 KIR3DL3Q8N743 410 aa5.6□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 OCC1Q8TAD7 63 aa5.6□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa5.6□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 THYN1Q9P016 225 aa5.6□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 INSIG2Q9Y5U4 225 aa5.6□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 CSMD1Q96PZ7 3565 aa5.6□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PPI3 338 aa5.6□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 IGLV2-23P01705 113 aa5.6□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 CRYBB3P26998 211 aa5.6□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 ZNF90Q03938 601 aa5.6□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 VSTM2AQ8TAG5 236 aa5.6□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 IMMP2LQ96T52 175 aa5.6□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 NUDT3O95989 172 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 MOSP00540 346 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 IGHV4-31P0DP07 118 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 AREGP15514 252 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 MPV17L2Q567V2 206 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 PNKDQ8N490 385 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 C16orf95Q9H693 158 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 SVEP1Q4LDE5 3571 aa5.59□□□□□ -1.51
HERC4-211ENST00000492996 A0A1B0GW15 77 aa5.59□□□□□ -1.51
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