RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 CD24P25063 80 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-213ENST00000492657 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
PRAME-213ENST00000492657 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-213ENST00000492657 Q8N976 141 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-213ENST00000492657 RPEQ96AT9 228 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-213ENST00000492657 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa10.27□□□□□ -0.77
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PRAME-213ENST00000492657 TNFRSF19Q9NS68 423 aa10.27□□□□□ -0.77
PRAME-213ENST00000492657 A0A1W2PRE2 83 aa10.26□□□□□ -0.77
PRAME-213ENST00000492657 PAFAH1B2P68402 229 aa10.26□□□□□ -0.77
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PRAME-213ENST00000492657 LINC00305Q7Z4B0 112 aa10.26□□□□□ -0.77
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PRAME-213ENST00000492657 OR8B2Q96RD0 313 aa10.25□□□□□ -0.77
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PRAME-213ENST00000492657 LY6G5BQ8NDX9 201 aa10.23□□□□□ -0.77
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PRAME-213ENST00000492657 OSTCQ9NRP0 149 aa10.23□□□□□ -0.77
PRAME-213ENST00000492657 LOC105371242A0A075B767 164 aa10.22□□□□□ -0.77
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PRAME-213ENST00000492657 C22orf15Q8WYQ4 148 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-213ENST00000492657 ZNF586Q9NXT0 402 aa10.22□□□□□ -0.77
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PRAME-213ENST00000492657 ISLRO14498 428 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-213ENST00000492657 ESDP10768 282 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-213ENST00000492657 TMEM136Q6ZRR5 245 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-213ENST00000492657 TMEM116Q8NCL8 245 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-213ENST00000492657 TRGV9Q99603 122 aa10.22□□□□□ -0.77
PRAME-213ENST00000492657 RPH3ALQ9UNE2 315 aa10.22□□□□□ -0.77
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PRAME-213ENST00000492657 PMCHL1Q16048 86 aa10.21□□□□□ -0.77
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PRAME-213ENST00000492657 C11orf71Q6IPW1 123 aa10.21□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 WDR73Q6P4I2 378 aa10.21□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 S4R3C0 116 aa10.21□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 PGPA6NDG6 321 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 HTR1DP28221 377 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 PERPQ96FX8 193 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa10.2□□□□□ -0.78
PRAME-213ENST00000492657 CFAP46Q8IYW2 2715 aa10.2□□□□□ -0.78
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