RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	CTSG	P08311	255 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	CD28	P10747	220 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR10J1	P30954	320 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	FHIT	P49789	147 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF726P1	Q15940	193 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	C15orf32	Q32M92	178 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	TIGIT	Q495A1	244 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	MIC13	Q5XKP0	118 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	BTNL8	Q6UX41	500 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR4X1	Q8NH49	305 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	ACY3	Q96HD9	319 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM68	Q96MH6	324 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	C17orf77	Q96MU5	243 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	PPP5D1	E7EU14	171 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	FNDC10	F2Z333	226 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266		I3L521	148 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	BMPR1B	O00238	502 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	AGPAT2	O15120	278 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLN5	O75503	358 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRGV3	P03979	118 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPP1	P10451	314 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	FGF7	P21781	194 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARL3	P36405	182 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	OPRK1	P41145	380 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATP6V1F	Q16864	119 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC51B	Q86UW2	128 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	STX12	Q86Y82	276 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	BAP18	Q8IXM2	172 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	NECAP1	Q8NC96	275 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMED6	Q8WW62	240 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	DUX3	Q96PT4	197 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR5B12	Q96R08	314 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	GGACT	Q9BVM4	153 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMCO3	A2RU48	225 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM89	A2RUT3	159 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR2T8	A6NH00	312 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266		A8MZ25	164 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266		H3BUA1	57 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	TAAR5	O14804	337 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPR183	P32249	361 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	4.67	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	TPPP2	P59282	170 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAB2A	P61019	212 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAB11A	P62491	216 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	HBG1	P69891	147 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	HBG2	P69892	147 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	ATP5G2	Q06055	141 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	DEFB136	Q30KP8	78 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	TEX261	Q6UWH6	196 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRGV9	Q99603	122 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	RPRM	Q9NS64	109 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	VWF	P04275	2813 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	COL6A5	A8TX70	2615 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A087WW49	117 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RABGGTB-212	ENST00000491266	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		4.66	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms