RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ABCA2Q9BZC7 2435 aa13.59□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa13.59□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A1W2PRX2 142 aa13.58□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AMBPP02760 352 aa13.58□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPL15P61313 204 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.23
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PVRIGQ6DKI7 326 aa13.58□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HIST3H2BBQ8N257 126 aa13.58□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q6ZS92 163 aa13.58□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM256Q8N2U0 113 aa13.58□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa13.58□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGHG3P01860 377 aa13.58□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC00469Q8N7U9 141 aa13.58□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NUDT10Q8NFP7 164 aa13.58□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NUDT11Q96G61 164 aa13.58□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CRIM1Q9NZV1 1036 aa13.58□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UBE2L6O14933 153 aa13.57□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WNT2P09544 360 aa13.57□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GAFA1Q96PS6 74 aa13.57□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SCGB3A1Q96QR1 104 aa13.57□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa13.57□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa13.57□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa13.57□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM181BA6NEQ2 426 aa13.57□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MST1LQ2TV78 715 aa13.57□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC00479Q96M42 142 aa13.57□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMAGPQ0VAQ4 97 aa13.56□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C15orf32Q32M92 178 aa13.56□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM169BQ8N8A8 192 aa13.56□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C8orf46Q8TAG6 207 aa13.56□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGF2RP11717 2491 aa13.56□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NIT1Q86X76 327 aa13.56□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 H0YJW9 148 aa13.55□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPSB3Q6PJ21 355 aa13.55□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BRD3OSQ6XYD6 125 aa13.55□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NDUFAF3Q9BU61 184 aa13.55□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 JKAMPQ9P055 326 aa13.55□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC00614P0C842 121 aa13.55□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EVI2AP22794 236 aa13.55□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q6AWC8 147 aa13.55□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa13.55□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGFL4Q6B9Z1 124 aa13.54□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SFTA2Q6UW10 78 aa13.54□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q6ZS49 121 aa13.54□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ASCL2Q99929 193 aa13.54□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMIM13P0DJ93 91 aa13.54□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COL8A2P25067 703 aa13.54□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MEIG1Q5JSS6 88 aa13.54□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa13.54□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM242Q9NWH2 141 aa13.54□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NDUFA3O95167 84 aa13.54□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CFPP27918 469 aa13.54□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q6ZR03 302 aa13.54□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TSKUQ8WUA8 353 aa13.54□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa13.54□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WIPF3A6NGB9 483 aa13.54□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CD7P09564 240 aa13.54□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LYL1P12980 280 aa13.54□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PYY3Q5JQD4 70 aa13.53□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM90A2PQ658T7 463 aa13.53□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TNFRSF14Q92956 283 aa13.53□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TECTAO75443 2155 aa13.53□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LEPP41159 167 aa13.53□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q8TAT8 98 aa13.53□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DUX3Q96PT4 197 aa13.53□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GNB1LQ9BYB4 327 aa13.53□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa13.53□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATP5LO75964 103 aa13.52□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WDR86Q86TI4 376 aa13.52□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TTC9CQ8N5M4 171 aa13.52□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TSPAN13O95857 204 aa13.52□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VMO1Q7Z5L0 202 aa13.52□□□□□ -0.24
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NCR2O95944 276 aa13.52□□□□□ -0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A1B0GWJ7 208 aa13.52□□□□□ -0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 APOMO95445 188 aa13.52□□□□□ -0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LCN12Q6JVE5 192 aa13.52□□□□□ -0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C10orf126Q8N4M7 172 aa13.52□□□□□ -0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PF4P02776 101 aa13.51□□□□□ -0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CACNG7P62955 275 aa13.51□□□□□ -0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SIGLEC9Q9Y336 463 aa13.51□□□□□ -0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FXYD7P58549 80 aa13.51□□□□□ -0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A1B0GWB2 263 aa13.51□□□□□ -0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.6 ms