RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478910.5

DLGAP4-208, Transcript of DLG associated protein 4, human

TSL 2

Gene DLGAP4, Length 2,674 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DLGAP4-208	ENST00000478910	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
DLGAP4-208	ENST00000478910	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
DLGAP4-208	ENST00000478910	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
DLGAP4-208	ENST00000478910	EFNB3	Q15768	340 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DLGAP4-208	ENST00000478910	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DLGAP4-208	ENST00000478910	RAB1C	Q92928	201 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DLGAP4-208	ENST00000478910	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DLGAP4-208	ENST00000478910	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		11.66	□□□□□ -0.54
DLGAP4-208	ENST00000478910	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DLGAP4-208	ENST00000478910	HTR1D	P28221	377 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DLGAP4-208	ENST00000478910	HSD52	Q0P140	79 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DLGAP4-208	ENST00000478910	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
DLGAP4-208	ENST00000478910	OR4A5	Q8NH83	315 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DLGAP4-208	ENST00000478910	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DLGAP4-208	ENST00000478910	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
DLGAP4-208	ENST00000478910		C9JCJ5	164 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DLGAP4-208	ENST00000478910		H3BUT2	72 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DLGAP4-208	ENST00000478910	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
DLGAP4-208	ENST00000478910	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
DLGAP4-208	ENST00000478910	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DLGAP4-208	ENST00000478910	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DLGAP4-208	ENST00000478910	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DLGAP4-208	ENST00000478910	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
DLGAP4-208	ENST00000478910	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DLGAP4-208	ENST00000478910	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DLGAP4-208	ENST00000478910	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
DLGAP4-208	ENST00000478910	TCF19	Q9Y242	345 aa		11.65	□□□□□ -0.54
DLGAP4-208	ENST00000478910	UQCRFS1	P47985	274 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	KIR2DS2	P43631	304 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	FXYD3	Q14802	87 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	JMJD8	Q96S16	334 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	COL12A1	Q99715	3063 aa		11.64	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910		A6NDN8	102 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910		H3BRM9	83 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	CXorf1	O96002	111 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	HINT2	Q9BX68	163 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	C15orf61	A6NNL5	157 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	PPOX	P50336	477 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	SLA	Q13239	276 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	CACNA1A	O00555	2505 aa		11.63	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	GNG4	P50150	75 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	DLX6	P56179	175 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910		Q8N7P7	452 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	PSMB11	A5LHX3	300 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910		K7EQM0	130 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	VWC2	Q2TAL6	325 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	OR52E5	Q8NH55	327 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	PERP	Q96FX8	193 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		11.62	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	AKAP6	Q13023	2319 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910		A0A0G2JLM5	398 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	C1RL	Q9NZP8	487 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	CD1B	P29016	333 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	PRORY	Q9H606	182 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	OSTC	Q9NRP0	149 aa		11.61	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	PRSS46	E5RG02	174 aa		11.6	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	DLL1	O00548	723 aa		11.6	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	CENPW	Q5EE01	88 aa		11.6	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		11.6	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		11.6	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	PLXNB1	O43157	2135 aa		11.6	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		11.6	□□□□□ -0.55
DLGAP4-208	ENST00000478910	STAG3L2	P0CL84	134 aa		11.6	□□□□□ -0.55

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