RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457708.1

USP9YP25-201, Transcript of USP9Y pseudogene 25, humanhuman

BASIC

Gene USP9YP25, Length 443 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP25-201ENST00000457708 MED29Q9NX70 200 aa0.18□□□□□ -2.38
USP9YP25-201ENST00000457708 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa0.18□□□□□ -2.38
USP9YP25-201ENST00000457708 A8MWV9 139 aa0.17□□□□□ -2.38
USP9YP25-201ENST00000457708 H3BRM9 83 aa0.17□□□□□ -2.38
USP9YP25-201ENST00000457708 SMIM17P0DL12 118 aa0.17□□□□□ -2.38
USP9YP25-201ENST00000457708 Q6ZS92 163 aa0.17□□□□□ -2.38
USP9YP25-201ENST00000457708 GRINAQ7Z429 371 aa0.17□□□□□ -2.38
USP9YP25-201ENST00000457708 TSKUQ8WUA8 353 aa0.17□□□□□ -2.38
USP9YP25-201ENST00000457708 TMEM133Q9H2Q1 129 aa0.17□□□□□ -2.38
USP9YP25-201ENST00000457708 TNCP24821 2201 aa0.17□□□□□ -2.38
USP9YP25-201ENST00000457708 KIF1BO60333 1816 aa0.16□□□□□ -2.38
USP9YP25-201ENST00000457708 F8W1H4 67 aa0.16□□□□□ -2.38
USP9YP25-201ENST00000457708 K7EIL1 84 aa0.16□□□□□ -2.38
USP9YP25-201ENST00000457708 M0R378 163 aa0.16□□□□□ -2.38
USP9YP25-201ENST00000457708 HIST1H3AP68431 136 aa0.16□□□□□ -2.38
USP9YP25-201ENST00000457708 H3F3AP84243 136 aa0.16□□□□□ -2.38
USP9YP25-201ENST00000457708 EDDM3AQ14507 147 aa0.16□□□□□ -2.38
USP9YP25-201ENST00000457708 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa0.16□□□□□ -2.38
USP9YP25-201ENST00000457708 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa0.16□□□□□ -2.38
USP9YP25-201ENST00000457708 OR52L1Q8NGH7 329 aa0.16□□□□□ -2.38
USP9YP25-201ENST00000457708 SLC25A40Q8TBP6 338 aa0.16□□□□□ -2.38
USP9YP25-201ENST00000457708 LYSMD1Q96S90 227 aa0.16□□□□□ -2.38
USP9YP25-201ENST00000457708 PSTPIP2Q9H939 334 aa0.16□□□□□ -2.38
USP9YP25-201ENST00000457708 LY96Q9Y6Y9 160 aa0.16□□□□□ -2.38
USP9YP25-201ENST00000457708 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
USP9YP25-201ENST00000457708 TRAV10A0A0B4J240 114 aa0.15□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 CEBPGP53567 150 aa0.15□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 FXYD6P3P58550 94 aa0.15□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 ZGRF1Q86YA3 2104 aa0.15□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 Q8IYB0 196 aa0.15□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 OR5D14Q8NGL3 314 aa0.15□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 CCDC42Q96M95 316 aa0.15□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 TMEM138Q9NPI0 162 aa0.15□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 PCTPQ9UKL6 214 aa0.15□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 PIK3C2GO75747 1445 aa0.14□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 PDE6DO43924 150 aa0.14□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 MYL5Q02045 173 aa0.14□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 ATOH7Q8N100 152 aa0.14□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 GLTPQ9NZD2 209 aa0.14□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 JPT1Q9UK76 154 aa0.14□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 FANCMQ8IYD8 2048 aa0.14□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 CECR2Q9BXF3 1484 aa0.14□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 FMN1Q68DA7 1419 aa0.13□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 PTPRFP10586 1907 aa0.13□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 A0A087WUJ7 227 aa0.13□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 ERC2-IT1O76042 136 aa0.13□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 RPP14O95059 124 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 COX7CP15954 63 aa0.13□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 C22orf39Q6P5X5 142 aa0.13□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 OR51A2Q8NGJ7 313 aa0.13□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 BDP1A6H8Y1 2624 aa0.13□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 KNTC1P50748 2209 aa0.13□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 E7EUB6 86 aa0.12□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 NDUFB3O43676 98 aa0.12□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 CD2P06729 351 aa0.12□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 FREM3P0C091 2139 aa0.12□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 SPTBP11277 2137 aa0.12□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 KDELR1P24390 212 aa0.12□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 BCL2L15Q5TBC7 163 aa0.12□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 PDZD9Q8IXQ8 264 aa0.12□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 OR10K1Q8NGX5 313 aa0.12□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 UQCC1Q9NVA1 299 aa0.12□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 HSPB8Q9UJY1 196 aa0.12□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 ARHGEF11O15085 1522 aa0.12□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 MYLKQ15746 1914 aa0.11□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa0.11□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 ZNF137PP52743 207 aa0.11□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 RANP62826 216 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 SPATA45Q537H7 98 aa0.11□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa0.11□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa0.11□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 PBOV1Q9GZY1 135 aa0.11□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 TMEM126AQ9H061 195 aa0.11□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP0.1□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 C17orf112F2Z3M2 114 aa0.1□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 CXCL8P10145 99 aa0.1□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 SRIP30626 198 aa0.1□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 ROMO1P60602 79 aa0.1□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 TMEM97Q5BJF2 176 aa0.1□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa0.1□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 RNF11Q9Y3C5 154 aa0.1□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.39
USP9YP25-201ENST00000457708 SMIM9A6NGZ8 99 aa0.09□□□□□ -2.4
USP9YP25-201ENST00000457708 PIGPP57054 158 aa0.09□□□□□ -2.4
USP9YP25-201ENST00000457708 RRN3P1Q2M238 152 aa0.09□□□□□ -2.4
USP9YP25-201ENST00000457708 MUCL1Q96DR8 90 aa0.09□□□□□ -2.4
USP9YP25-201ENST00000457708 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
USP9YP25-201ENST00000457708 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa0.08□□□□□ -2.4
USP9YP25-201ENST00000457708 GGCTO75223 188 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
USP9YP25-201ENST00000457708 ERP29P30040 261 aaKnown RBP0.08□□□□□ -2.4
USP9YP25-201ENST00000457708 CDK6Q00534 326 aa0.08□□□□□ -2.4
USP9YP25-201ENST00000457708 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa0.08□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms