RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227065.8

FAM149A-201, Transcript of family with sequence similarity 149 member A, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM149A, Length 2,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149A-201ENST00000227065 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa21.65■■□□□ 1.06
FAM149A-201ENST00000227065 CEACAM4O75871 244 aa21.65■■□□□ 1.06
FAM149A-201ENST00000227065 NUDT3O95989 172 aa21.65■■□□□ 1.06
FAM149A-201ENST00000227065 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa21.64■■□□□ 1.06
FAM149A-201ENST00000227065 STXBP6Q8NFX7 210 aa21.64■■□□□ 1.06
FAM149A-201ENST00000227065 TPRP12270 2363 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
FAM149A-201ENST00000227065 CSN3P07498 182 aa21.64■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 ADIPOQQ15848 244 aa21.64■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 VMA21Q3ZAQ7 101 aa21.64■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 PIP4P1Q86T03 277 aa21.64■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 PPIAL4EA0A075B759 164 aa21.64■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 PPIAL4DF5H284 164 aa21.64■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 PPIAL4FP0DN26 164 aa21.64■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 WFDC8Q8IUA0 241 aa21.64■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 ASCL2Q99929 193 aa21.64■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 Q9H3A6 140 aa21.64■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 C19orf71A6NCJ1 209 aa21.63■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 CRXO43186 299 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 NUP37Q8NFH4 326 aa21.63■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 LTAP01374 205 aa21.62■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 TCRAP04437 139 aa21.62■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM108Q6UXF1 575 aa21.62■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 CHEK1O14757 476 aa21.62■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 NDUFB3O43676 98 aa21.62■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 RNF151Q2KHN1 245 aa21.62■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 C5orf17Q8NAS9 161 aa21.62■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 ST20Q9HBF5 79 aa21.62■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 GP9P14770 177 aa21.61■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 CACNA1HO95180 2353 aa21.61■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM178BH3BS89 294 aa21.61■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 DLX1P56177 255 aa21.61■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 RNF24Q9Y225 148 aa21.61■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa21.6■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 MUC21A0A140T8X8 626 aa21.6■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 CRYGCP07315 174 aa21.6■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 MUC21Q5SSG8 566 aa21.6■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 K7EM74 188 aa21.6■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 ETFRF1Q6IPR1 90 aa21.6■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 FMC1Q96HJ9 113 aa21.6■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 CTSZQ9UBR2 303 aa21.6■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 OR2T8A6NH00 312 aa21.59■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 K7EP13 123 aa21.59■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 COL8A1P27658 744 aa21.59■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 LRRC10Q5BKY1 277 aa21.59■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 TAX1BP3O14907 124 aa21.59■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 CNTFRP26992 372 aa21.59■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 SLC25A34Q6PIV7 304 aa21.59■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 LINC00311Q8N616 119 aa21.59■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 TRGV9Q99603 122 aa21.59■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 CBY3A6NI87 242 aa21.58■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa21.58■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 FAM71F2Q6NXP2 309 aa21.58■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa21.58■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 SMIM12Q96EX1 92 aa21.58■■□□□ 1.05
FAM149A-201ENST00000227065 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa21.58■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 PRNTQ86SH4 94 aa21.57■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 TMUB1Q9BVT8 246 aa21.57■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM191AQ9H0A3 160 aa21.57■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 BSPH1Q075Z2 132 aa21.57■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 FAM162BQ5T6X4 162 aa21.57■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 LOXP28300 417 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 MC5RP33032 325 aa21.57■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 A0A087X0K7 114 aa21.56■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 CT83Q5H943 113 aa21.56■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 Q6ZS92 163 aa21.56■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF492Q9P255 531 aa21.56■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 HSBP1L1C9JCN9 74 aa21.56■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 FOXE3Q13461 319 aa21.56■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 IGFL3Q6UXB1 125 aa21.56■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa21.56■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 Q86TA4 180 aa21.56■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM116Q8NCL8 245 aa21.56■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 LYZP61626 148 aa21.55■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa21.55■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 SNAI2O43623 268 aa21.55■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 LGALS7P47929 136 aa21.55■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 DLX6P56179 175 aa21.55■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 C8orf46Q8TAG6 207 aa21.55■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 C1RLQ9NZP8 487 aa21.55■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 ATMQ13315 3056 aa21.55■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 LIPFP07098 398 aa21.54■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 C8orf31Q8N9H6 132 aa21.54■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 CSMD1Q96PZ7 3565 aa21.54■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 HTR1DP28221 377 aa21.54■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 SCRT2Q9NQ03 307 aa21.54■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa21.53■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa21.53■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 C16orf97H3BN30 126 aa21.53■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 IGHV1-8P0DP01 117 aa21.53■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 NDFIP1Q9BT67 221 aa21.53■■□□□ 1.04
FAM149A-201ENST00000227065 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms