RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591126.5

SMAD4-212, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SMAD4, Length 4,970 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-212ENST00000591126 C22orf46C9J442 243 aa5.06□□□□□ -1.6
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SMAD4-212ENST00000591126 POU2AF1Q16633 256 aa5.06□□□□□ -1.6
SMAD4-212ENST00000591126 NMSQ5H8A3 153 aa5.06□□□□□ -1.6
SMAD4-212ENST00000591126 MIC13Q5XKP0 118 aa5.06□□□□□ -1.6
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SMAD4-212ENST00000591126 C5orf66Q9H5L9 145 aa5.05□□□□□ -1.6
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SMAD4-212ENST00000591126 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa5.03□□□□□ -1.6
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SMAD4-212ENST00000591126 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
SMAD4-212ENST00000591126 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
SMAD4-212ENST00000591126 TOMM20LQ6UXN7 152 aa5.03□□□□□ -1.6
SMAD4-212ENST00000591126 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa5.03□□□□□ -1.6
SMAD4-212ENST00000591126 TP53RKQ96S44 253 aa5.03□□□□□ -1.6
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SMAD4-212ENST00000591126 SRD5A3Q9H8P0 318 aa5.03□□□□□ -1.6
SMAD4-212ENST00000591126 COL6A6A6NMZ7 2263 aa5.03□□□□□ -1.6
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