RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	IAPP	P10997	89 aa		15.94	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	BTC	P35070	178 aa		15.94	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		15.94	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		15.94	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	MED6	O75586	246 aa		15.93	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF688	P0C7X2	276 aa		15.93	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	15.93	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	15.93	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF90	Q03938	601 aa		15.93	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	15.93	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF125	Q96EQ8	232 aa		15.93	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		15.93	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	PRSS46	E5RG02	174 aa		15.92	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	SYNGR2	O43760	224 aa		15.92	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	15.92	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	15.92	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	INPP1	P49441	399 aa		15.92	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC35E1	Q96K37	410 aa		15.92	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	15.92	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		15.92	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		15.91	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	ZFP92	A6NM28	416 aa		15.91	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB11A	P62491	216 aa		15.91	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	DHRS2	Q13268	280 aa		15.91	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	STH	Q8IWL8	128 aa		15.91	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	RARRES2	Q99969	163 aa		15.91	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	ADAP1	O75689	374 aa		15.9	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	JTB	O76095	146 aa		15.9	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	IL7	P13232	177 aa		15.9	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	ID3	Q02535	119 aa		15.9	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		15.9	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		15.9	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	OR11H2	Q8NH07	326 aa		15.9	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	NRN1	Q9NPD7	142 aa		15.9	■□□□□ 0.14
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		15.89	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	KNCN	A6PVL3	124 aa		15.89	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4E1	P0C645	316 aa		15.89	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	PMS2P11	Q13670	270 aa		15.89	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		15.89	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	THAP8	Q8NA92	274 aa		15.89	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	TRGV9	Q99603	122 aa		15.89	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	15.89	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	15.89	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		15.89	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	CXorf65	A6NEN9	183 aa		15.88	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	WRB	O00258	174 aa		15.88	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	15.87	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	PSMG4	Q5JS54	123 aa		15.87	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		15.87	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB40C	Q96S21	281 aa		15.87	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		15.87	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	15.87	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	NUPR2	A6NF83	97 aa		15.86	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	CENPX	A8MT69	81 aa		15.86	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		15.86	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	FABP1	P07148	127 aa		15.86	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	SPP1	P10451	314 aa		15.86	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	15.86	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	15.86	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	15.86	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	15.86	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		15.86	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	COQ8A	Q8NI60	647 aa		15.86	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	15.86	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	PLA2G10	O15496	165 aa		15.85	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	C4BPB	P20851	252 aa		15.85	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		15.85	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	KMT2A	Q03164	3969 aa		15.85	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200		H3BP45	60 aa		15.85	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	LYZ	P61626	148 aa		15.85	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	15.85	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	15.85	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2F1	Q13607	317 aa		15.85	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		15.85	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		15.85	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	C4orf46	Q504U0	113 aa		15.84	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		15.84	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		15.84	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	15.84	■□□□□ 0.13
PPP4C-205	ENST00000563200	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	15.83	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		15.83	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200		Q8NAQ8	132 aa		15.83	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	15.83	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		15.82	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	15.82	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	SOCS3	O14543	225 aa		15.82	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	IFNA21	P01568	189 aa		15.82	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	15.82	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		15.82	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	MITD1	Q8WV92	249 aa		15.82	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		15.82	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200		H3BMM0	161 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	DEFB4A	O15263	64 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	15.81	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	PAX9	P55771	341 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	SMIM8	Q96KF7	97 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	FBXL17	Q9UF56	701 aa		15.81	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	LYRM1	O43325	122 aa		15.8	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	15.8	■□□□□ 0.12
PPP4C-205	ENST00000563200	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		15.8	■□□□□ 0.12

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