RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492485.5

TRIOBP-211, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRIOBP, Length 3,948 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-211ENST00000492485 PSG1P11464 419 aa10.15□□□□□ -0.78
TRIOBP-211ENST00000492485 SPRNQ5BIV9 151 aa10.15□□□□□ -0.78
TRIOBP-211ENST00000492485 ARL17AQ8IVW1 177 aa10.15□□□□□ -0.78
TRIOBP-211ENST00000492485 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa10.15□□□□□ -0.78
TRIOBP-211ENST00000492485 AHRRA9YTQ3 701 aa10.15□□□□□ -0.78
TRIOBP-211ENST00000492485 K7EMI3 77 aa10.15□□□□□ -0.78
TRIOBP-211ENST00000492485 PLP1P60201 277 aa10.15□□□□□ -0.78
TRIOBP-211ENST00000492485 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa10.15□□□□□ -0.78
TRIOBP-211ENST00000492485 FBLN7Q53RD9 439 aa10.15□□□□□ -0.78
TRIOBP-211ENST00000492485 LINC01560Q8TB33 94 aa10.15□□□□□ -0.78
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM160Q9NX00 188 aa10.15□□□□□ -0.78
TRIOBP-211ENST00000492485 REV3LO60673 3130 aa10.15□□□□□ -0.78
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TRIOBP-211ENST00000492485 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
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TRIOBP-211ENST00000492485 K7ERU9 68 aa10.14□□□□□ -0.79
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TRIOBP-211ENST00000492485 Q1RN00 199 aa10.14□□□□□ -0.79
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TRIOBP-211ENST00000492485 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa10.14□□□□□ -0.79
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TRIOBP-211ENST00000492485 MKRN2OSH3BPM6 223 aa10.14□□□□□ -0.79
TRIOBP-211ENST00000492485 HLA-DRB1P01911 266 aa10.14□□□□□ -0.79
TRIOBP-211ENST00000492485 ODF3L1Q8IXM7 274 aa10.14□□□□□ -0.79
TRIOBP-211ENST00000492485 C1orf174Q8IYL3 243 aa10.14□□□□□ -0.79
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TRIOBP-211ENST00000492485 Q8TAT8 98 aa10.14□□□□□ -0.79
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TRIOBP-211ENST00000492485 LINC00470Q9BZP3 86 aa10.14□□□□□ -0.79
TRIOBP-211ENST00000492485 C15orf61A6NNL5 157 aa10.14□□□□□ -0.79
TRIOBP-211ENST00000492485 NUP35Q8NFH5 326 aa10.14□□□□□ -0.79
TRIOBP-211ENST00000492485 C2orf16Q68DN1 1984 aa10.13□□□□□ -0.79
TRIOBP-211ENST00000492485 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa10.13□□□□□ -0.79
TRIOBP-211ENST00000492485 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa10.13□□□□□ -0.79
TRIOBP-211ENST00000492485 GGTLC3B5MD39 225 aa10.13□□□□□ -0.79
TRIOBP-211ENST00000492485 K7EN84 100 aa10.13□□□□□ -0.79
TRIOBP-211ENST00000492485 KIR2DS2P43631 304 aa10.13□□□□□ -0.79
TRIOBP-211ENST00000492485 RIGQ13278 110 aa10.13□□□□□ -0.79
TRIOBP-211ENST00000492485 VWC2Q2TAL6 325 aa10.13□□□□□ -0.79
TRIOBP-211ENST00000492485 SSC4DQ8WTU2 575 aa10.13□□□□□ -0.79
TRIOBP-211ENST00000492485 U3KQA8 63 aa10.13□□□□□ -0.79
TRIOBP-211ENST00000492485 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
TRIOBP-211ENST00000492485 A0A1B0GW64 132 aa10.13□□□□□ -0.79
TRIOBP-211ENST00000492485 C16orf97H3BN30 126 aa10.13□□□□□ -0.79
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TRIOBP-211ENST00000492485 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
TRIOBP-211ENST00000492485 ZNF146Q15072 292 aa10.13□□□□□ -0.79
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM144Q7Z5S9 345 aa10.13□□□□□ -0.79
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TRIOBP-211ENST00000492485 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa10.13□□□□□ -0.79
TRIOBP-211ENST00000492485 AREGP15514 252 aa10.13□□□□□ -0.79
TRIOBP-211ENST00000492485 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
TRIOBP-211ENST00000492485 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP10.13□□□□□ -0.79
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TRIOBP-211ENST00000492485 HSPB8Q9UJY1 196 aa10.13□□□□□ -0.79
TRIOBP-211ENST00000492485 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa10.12□□□□□ -0.79
TRIOBP-211ENST00000492485 TMEM189A5PLL7 270 aa10.12□□□□□ -0.79
TRIOBP-211ENST00000492485 PMS2P5A8MQ11 134 aa10.12□□□□□ -0.79
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TRIOBP-211ENST00000492485 LINC00173Q6ZV60 143 aa10.12□□□□□ -0.79
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TRIOBP-211ENST00000492485 M0R296 226 aa10.11□□□□□ -0.79
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TRIOBP-211ENST00000492485 TPSG1Q9NRR2 321 aa10.11□□□□□ -0.79
TRIOBP-211ENST00000492485 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa10.11□□□□□ -0.79
TRIOBP-211ENST00000492485 BEND2Q8NDZ0 799 aa10.11□□□□□ -0.79
TRIOBP-211ENST00000492485 NEUROG1Q92886 237 aa10.11□□□□□ -0.79
TRIOBP-211ENST00000492485 SCGB2A1O75556 95 aa10.1□□□□□ -0.79
TRIOBP-211ENST00000492485 FTH1P19P0C7X4 201 aa10.1□□□□□ -0.79
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TRIOBP-211ENST00000492485 IZUMO1RA6ND01 250 aa10.1□□□□□ -0.79
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TRIOBP-211ENST00000492485 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
TRIOBP-211ENST00000492485 GOSR1O95249 250 aa10.1□□□□□ -0.79
TRIOBP-211ENST00000492485 IGLV3-1P01715 115 aa10.1□□□□□ -0.79
TRIOBP-211ENST00000492485 CNTFRP26992 372 aa10.1□□□□□ -0.79
TRIOBP-211ENST00000492485 RELQ04864 619 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
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