RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446688.5

TNS1-209, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 4,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-209ENST00000446688 MTURNQ8N3F0 131 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 MDS2Q8NDY4 140 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 DUX5Q96PT3 197 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 COL4A3Q01955 1670 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 SRRM5B3KS81 715 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 NPIPB6E9PJ23 425 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 RAMP3O60896 148 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 THBDP07204 575 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 IGLC2P0DOY2 106 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 IGLC3P0DOY3 106 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 SEC11AP67812 179 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 FAM74A4Q5TZK3 123 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 NUDT10Q8NFP7 164 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 RAB37Q96AX2 223 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 GGTLC1Q9BX51 225 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 MS4A6AQ9H2W1 248 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 FRMPD3Q5JV73 1810 aa8.26□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 PEX7O00628 323 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 CRXO43186 299 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 PSMB2P49721 201 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 TREML4Q6UXN2 200 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 TMEM144Q7Z5S9 345 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 SYT8Q8NBV8 401 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 CACNG8Q8WXS5 425 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 A0A1B0GUS0 222 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 IGLV3-1P01715 115 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 Q6ZS92 163 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 OR52E5Q8NH55 327 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 M0R3E3 92 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP8.25□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 CLEC19AQ6UXS0 136 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 YAE1D1Q9NRH1 226 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa8.25□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 NBR2O15453 112 aa8.24□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 FAM159AQ6UWV7 190 aa8.24□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa8.24□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 MED13Q9UHV7 2174 aa8.24□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 FAM181BA6NEQ2 426 aa8.24□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 UPK2O00526 184 aa8.24□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 PSPNO60542 156 aa8.24□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 RPS20P60866 119 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 SSC4DQ8WTU2 575 aa8.24□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 MEGF9Q9H1U4 602 aa8.24□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 IGF2RP11717 2491 aa8.24□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 HIGD1CA8MV81 97 aa8.24□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 WISP1O95388 367 aa8.24□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 SMIM13P0DJ93 91 aa8.24□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 GCSHP23434 173 aa8.24□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 ERASQ7Z444 233 aa8.24□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 OR1N2Q8NGR9 330 aa8.24□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 SCRT1Q9BWW7 348 aa8.24□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 TMEM136Q6ZRR5 245 aa8.23□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 KLK15Q9H2R5 256 aa8.23□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 JKAMPQ9P055 326 aa8.23□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 SLC25A15Q9Y619 301 aa8.23□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 COL4A6Q14031 1691 aa8.23□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 C7orf71A4D174 169 aa8.23□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 TIMM23O14925 209 aa8.23□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 AREGP15514 252 aa8.23□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 DUTP33316 252 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 TCF24Q7RTU0 167 aa8.23□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa8.23□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 RPL15P61313 204 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 ZNF585BQ52M93 769 aa8.23□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 SAMD13Q5VXD3 122 aa8.23□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 C5orf24Q7Z6I8 188 aa8.23□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 OR5A1Q8NGJ0 315 aa8.23□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 C5orf30Q96GV9 206 aa8.23□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 YPEL4Q96NS1 127 aa8.23□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 SPCS1Q9Y6A9 102 aa8.23□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 DENND4CQ5VZ89 1909 aa8.23□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 LCN12Q6JVE5 192 aa8.23□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 OR4X2Q8NGF9 303 aa8.23□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa8.23□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 C19orf67A6NJJ6 358 aa8.22□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 GPR82Q96P67 336 aa8.22□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa8.22□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 SORL1Q92673 2214 aa8.22□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 PCNTO95613 3336 aa8.22□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 A0A0G2JNJ9 132 aa8.22□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 B3GALT5-AS1P59052 145 aa8.22□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 MPV17L2Q567V2 206 aa8.22□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa8.22□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 TEX45Q8NA69 505 aa8.22□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 TSKUQ8WUA8 353 aa8.22□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 MAP1LC3AQ9H492 121 aa8.22□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 Q9UFV3 132 aa8.22□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 A0A1B0GW15 77 aa8.22□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 GNLYP22749 145 aa8.22□□□□□ -1.09
TNS1-209ENST00000446688 OR2K2Q8NGT1 345 aa8.22□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 127.1 ms