RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 SCGB2A1O75556 95 aa8.89□□□□□ -0.99
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CAPNS1-209ENST00000590049 ATP6V1FQ16864 119 aa8.89□□□□□ -0.99
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CAPNS1-209ENST00000590049 SLC35E1Q96K37 410 aa8.89□□□□□ -0.99
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CAPNS1-209ENST00000590049 C21orf62Q9NYP8 219 aa8.85□□□□□ -0.99
CAPNS1-209ENST00000590049 DNAH2Q9P225 4427 aa8.85□□□□□ -0.99
CAPNS1-209ENST00000590049 SORL1Q92673 2214 aa8.84□□□□□ -0.99
CAPNS1-209ENST00000590049 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa8.84□□□□□ -0.99
CAPNS1-209ENST00000590049 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa8.84□□□□□ -0.99
CAPNS1-209ENST00000590049 SOX15O60248 233 aa8.84□□□□□ -0.99
CAPNS1-209ENST00000590049 GNG7O60262 68 aa8.84□□□□□ -0.99
CAPNS1-209ENST00000590049 NDUFB8O95169 186 aa8.84□□□□□ -0.99
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