RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 TIMP3P35625 211 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-205ENST00000587860 RPL31P62899 125 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
CTIF-205ENST00000587860 Q8N976 141 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-205ENST00000587860 WDR83OSQ9Y284 106 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-205ENST00000587860 IGLC7A0M8Q6 106 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-205ENST00000587860 PLAUP00749 431 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-205ENST00000587860 CT45A6P0DMU7 189 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-205ENST00000587860 CT45A5P0DMU8 189 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-205ENST00000587860 CT45A7P0DMV0 189 aa12.27□□□□□ -0.45
CTIF-205ENST00000587860 GRNP28799 593 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
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CTIF-205ENST00000587860 WASHC3Q9Y3C0 194 aa12.27□□□□□ -0.45
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CTIF-205ENST00000587860 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa12.26□□□□□ -0.45
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CTIF-205ENST00000587860 SCNM1Q9BWG6 230 aa12.26□□□□□ -0.45
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CTIF-205ENST00000587860 OR51B2Q9Y5P1 312 aa12.26□□□□□ -0.45
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CTIF-205ENST00000587860 KBTBD11O94819 623 aa12.25□□□□□ -0.45
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CTIF-205ENST00000587860 LINC01560Q8TB33 94 aa12.25□□□□□ -0.45
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CTIF-205ENST00000587860 SCO2A0A1W2PP80 73 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-205ENST00000587860 J3QR06 171 aa12.25□□□□□ -0.45
CTIF-205ENST00000587860 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP12.25□□□□□ -0.453e-6■■■□□ 17.7
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CTIF-205ENST00000587860 CD99P14209 185 aa12.25□□□□□ -0.45
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CTIF-205ENST00000587860 STAG3L2P0CL84 134 aa12.24□□□□□ -0.45
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CTIF-205ENST00000587860 SPINK4O60575 86 aa12.23□□□□□ -0.45
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CTIF-205ENST00000587860 OR1B1Q8NGR6 318 aa12.23□□□□□ -0.45
CTIF-205ENST00000587860 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa12.23□□□□□ -0.45
CTIF-205ENST00000587860 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa12.23□□□□□ -0.45
CTIF-205ENST00000587860 NUDT3O95989 172 aa12.23□□□□□ -0.45
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CTIF-205ENST00000587860 FAM19A2Q8N3H0 131 aa12.23□□□□□ -0.45
CTIF-205ENST00000587860 OR2T6Q8NHC8 308 aa12.23□□□□□ -0.45
CTIF-205ENST00000587860 RNF125Q96EQ8 232 aa12.23□□□□□ -0.45
CTIF-205ENST00000587860 TPSG1Q9NRR2 321 aa12.23□□□□□ -0.45
CTIF-205ENST00000587860 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-205ENST00000587860 PRSS46E5RG02 174 aa12.22□□□□□ -0.45
CTIF-205ENST00000587860 ENSAO43768 121 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
CTIF-205ENST00000587860 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa12.22□□□□□ -0.45
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