RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NOXA1Q86UR1 476 aa17.19■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANXA3P12429 323 aa17.18■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NPY1RP25929 384 aa17.18■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CRYBB3P26998 211 aa17.18■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DEFB131AP59861 70 aa17.18■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ETFRF1Q6IPR1 90 aa17.18■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRSS54Q6PEW0 395 aa17.18■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR1S2Q8NGQ3 325 aa17.18■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 Q8WTZ3 238 aa17.18■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRAV2A0A0B4J234 112 aa17.17■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A0B4J2A0 478 aa17.17■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IFNA10P01566 189 aa17.17■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR10J1P30954 320 aa17.17■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 P2RY1P47900 373 aa17.17■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCR6P51684 374 aa17.17■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP17.17■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SMCO1Q147U7 214 aa17.17■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NMSQ5H8A3 153 aa17.17■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LEMD1Q68G75 181 aa17.17■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LYZL2Q7Z4W2 148 aa17.17■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LGI3Q8N145 548 aa17.17■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 STXBP6Q8NFX7 210 aa17.17■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GRAMD2BQ96HH9 432 aa17.17■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LYSTQ99698 3801 aa17.17■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SHPKQ9UHJ6 478 aa17.17■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGLC1P0CG04 106 aa17.16■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AP3S2P59780 193 aa17.16■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SRPXP78539 464 aa17.16■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TOMM5Q8N4H5 51 aa17.16■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM217Q8N7C4 229 aa17.16■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM170AQ8WVE7 144 aa17.16■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 S100A5P33763 92 aa17.15■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMED4Q7Z7H5 227 aa17.15■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM24BQ8N5W8 94 aa17.15■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NPIPB3Q92617 1050 aa17.15■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ACY3Q96HD9 319 aa17.15■□□□□ 0.34
HOXC-AS1-201ENST00000505700 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR1S1Q8NH92 325 aa17.14■□□□□ 0.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DTD1Q8TEA8 209 aa17.14■□□□□ 0.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GATAD1Q8WUU5 269 aa17.14■□□□□ 0.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RARRES2Q99969 163 aa17.14■□□□□ 0.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RBKSQ9H477 322 aa17.14■□□□□ 0.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HSPB7Q9UBY9 170 aa17.14■□□□□ 0.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 U3KQ87 197 aa17.14■□□□□ 0.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 STHQ8IWL8 128 aa17.13■□□□□ 0.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRIM63Q969Q1 353 aa17.13■□□□□ 0.33
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 NUPR2A6NF83 97 aa17.12■□□□□ 0.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 K7EQG2 157 aa17.12■□□□□ 0.33
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP17.12■□□□□ 0.33
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 IL4P05112 153 aa17.11■□□□□ 0.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RD3LP0DJH9 198 aa17.11■□□□□ 0.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM128Q5BJH2 165 aa17.11■□□□□ 0.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR11H2Q8NH07 326 aa17.11■□□□□ 0.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 U3KQE9 123 aa17.11■□□□□ 0.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HELTA6NFD8 242 aa17.1■□□□□ 0.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF688P0C7X2 276 aa17.1■□□□□ 0.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 VAMP1P23763 118 aa17.1■□□□□ 0.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TOMM40O96008 361 aa17.09■□□□□ 0.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DHRS2Q13268 280 aa17.09■□□□□ 0.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF79Q15937 498 aa17.09■□□□□ 0.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C16orf54Q6UWD8 224 aa17.09■□□□□ 0.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DNAH1Q9P2D7 4330 aa17.08■□□□□ 0.33
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DCANP1Q8TF63 244 aa17.08■□□□□ 0.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KNCNA6PVL3 124 aa17.07■□□□□ 0.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PSG1P11464 419 aa17.07■□□□□ 0.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC190Q86UF4 302 aa17.07■□□□□ 0.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GLMPQ8WWB7 406 aa17.07■□□□□ 0.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AGRNO00468 2067 aa17.07■□□□□ 0.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR51G1Q8NGK1 321 aa17.06■□□□□ 0.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DEDD2Q8WXF8 326 aa17.06■□□□□ 0.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC35E1Q96K37 410 aa17.06■□□□□ 0.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZFP92A6NM28 416 aa17.05■□□□□ 0.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LY6G6CO95867 125 aa17.05■□□□□ 0.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ACTL10Q5JWF8 245 aa17.05■□□□□ 0.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPANXN2Q5MJ10 180 aa17.05■□□□□ 0.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LINC00476Q8WZB0 136 aa17.05■□□□□ 0.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PBDC1Q9BVG4 233 aa17.05■□□□□ 0.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PITX3O75364 302 aa17.04■□□□□ 0.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SFT2D2O95562 160 aa17.04■□□□□ 0.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IAPPP10997 89 aa17.04■□□□□ 0.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RAB11AP62491 216 aa17.04■□□□□ 0.32
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