RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF137PP52743 207 aa0.04□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP0.04□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HIST3H3Q16695 136 aa0.04□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPOPLQ6IQ16 392 aa0.04□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CLECL1Q8IZS7 167 aa0.04□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRT222Q8N1A0 295 aa0.04□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR13D1Q8NGV5 346 aa0.04□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TERB2Q8NHR7 220 aa0.04□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KLK6Q92876 244 aa0.04□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC90BQ9GZT6 254 aa0.04□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TLNRD1Q9H1K6 362 aa0.04□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa0.04□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP0.04□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa0.04□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIF13BQ9NQT8 1826 aa0.03□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NCOR2Q9Y618 2525 aa0.03□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa0.03□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 H3BRM9 83 aa0.03□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CRYZL1O95825 349 aa0.03□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ISG15P05161 165 aa0.03□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RBP1P09455 135 aa0.03□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR4E1P0C645 316 aa0.03□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa0.03□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CASP1P29466 404 aa0.03□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAGEA2P43356 314 aa0.03□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BLVRAP53004 296 aa0.03□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SKP1P63208 163 aa0.03□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PMAIP1Q13794 54 aa0.03□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ESRGQ1W209 222 aa0.03□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SFXN4Q6P4A7 337 aa0.03□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RAB8BQ92930 207 aa0.03□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa0.03□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa0.03□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPRR2GQ9BYE4 73 aa0.03□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa0.03□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa0.03□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C20orf27Q9GZN8 174 aa0.03□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FBXL12Q9NXK8 326 aa0.03□□□□□ -2.4
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COL7A1Q02388 2944 aa0.02□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A087X0T9 212 aa0.02□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa0.02□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 M0QZ92 97 aa0.02□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PIRO00625 290 aa0.02□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DEXIO95424 95 aa0.02□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AHSA1O95433 338 aa0.02□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RHOBP62745 196 aa0.02□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 QRFPP83859 136 aa0.02□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MYL5Q02045 173 aa0.02□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LINC01554Q52M75 96 aa0.02□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPATA45Q537H7 98 aa0.02□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BRMS1LQ5PSV4 323 aa0.02□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCDC122Q5T0U0 273 aa0.02□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa0.02□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM151BQ6UXP7 276 aa0.02□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GRINAQ7Z429 371 aa0.02□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DCUN1D1Q96GG9 259 aa0.02□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C2orf50Q96LR7 162 aa0.02□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HIST1H2BLQ99880 126 aa0.02□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CYSLTR1Q9Y271 337 aa0.02□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 V9GYY5 206 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ALPK3Q96L96 1907 aa0.02□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SCN3AQ9NY46 2000 aa0.02□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TNCP24821 2201 aa0.02□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A0D9SG42 100 aa0.01□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SMIM23A6NLE4 172 aa0.01□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM25EA8MYX2 175 aa0.01□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa0.01□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 F8W1H4 67 aa0.01□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP0.01□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TSNQ15631 228 aaKnown RBP0.01□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ALKAL1Q6UXT8 129 aa0.01□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C4orf22Q6V702 233 aa0.01□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR6V1Q8N148 313 aa0.01□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANKRD29Q8N6D5 301 aa0.01□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR2T35Q8NGX2 323 aa0.01□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM172AQ8WUF8 416 aa0.01□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LYSMD1Q96S90 227 aa0.01□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP0.01□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR51V1Q9H2C8 321 aa0.01□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP0.01□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM138Q9NPI0 162 aa0.01□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NUP155O75694 1391 aa0.01□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa0.01□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa0□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa0□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 H0Y980 276 aa0□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 M0R378 163 aa0□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPR31O00270 319 aa0□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TNNC2P02585 160 aa0□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TPRP12270 2363 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COX7CP15954 63 aa0□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMED1Q13445 227 aa0□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C6orf52Q5T4I8 152 aa0□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LYRM7Q5U5X0 104 aa0□□□□□ -2.41
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EVC2Q86UK5 1308 aa0□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.4 ms