RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452550.5

SH3BGR-208, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein, human

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene SH3BGR, Length 865 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BGR-208	ENST00000452550	SP6	Q3SY56	376 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	LGI3	Q8N145	548 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR4C16	Q8NGL9	310 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	IL22RA2	Q969J5	263 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550		U3KQK5	164 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550		A0A1W2PS18	150 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR2T8	A6NH00	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR4C46	A6NHA9	309 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	C2orf70	A6NJV1	201 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550		A8MWP6	167 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550		E7EUB6	86 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	NDUFA4	O00483	81 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	CDS2	O95674	445 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	FABP1	P07148	127 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	CSN3	P07498	182 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR5AC1	P0C628	307 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	CBLN1	P23435	193 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	OPRK1	P41145	380 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	CD81	P60033	236 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	KLK9	Q2XQG4	91 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	NRAC	Q8N912	160 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZNF114	Q8NC26	417 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR52E5	Q8NH55	327 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	TP53RK	Q96S44	253 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	GPR132	Q9UNW8	380 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550		S4R3C0	116 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550		A0A0B4J2A0	478 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	CXorf65	A6NEN9	183 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	C15orf62	A8K5M9	175 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550		K7EMT4	169 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	RHOD	O00212	210 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	ST8SIA3	O43173	380 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	MED6	O75586	246 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	MT-CO2	P00403	227 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	IFNA10	P01566	189 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	IFNA21	P01568	189 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	SLC25A4	P12235	298 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	S100A7	P31151	101 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	ETV6	P41212	452 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	CCR6	P51684	374 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	RAB11A	P62491	216 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	OR1S1	Q8NH92	325 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	TMEM230	Q96A57	120 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	GALNT14	Q96FL9	552 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	ASCL2	Q99929	193 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	NEURL2	Q9BR09	285 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	CACNG5	Q9UF02	275 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550		U3KQ87	197 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550		A0A0B4J293	547 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550		A0A1B0GU03	582 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550		A0A1B0GW64	132 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SH3BGR-208	ENST00000452550		A8MZ25	164 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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