RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427487.5

HDLBP-215, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 924 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-215ENST00000427487 TGOLN2O43493 480 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 IGKV1-17P01599 117 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 CLEC3BP05452 202 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 CTSGP08311 255 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 OR10J1P30954 320 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 RELQ04864 619 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 CLINT1Q14677 625 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 MLANAQ16655 118 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 PXDC1Q5TGL8 231 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 SLC51BQ86UW2 128 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 SCGB1C1Q8TD33 95 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 ACY3Q96HD9 319 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 CITED1Q99966 193 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 WFDC1Q9HC57 220 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 CYTL1Q9NRR1 136 aa9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 SMCO3A2RU48 225 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 ZFP92A6NM28 416 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 C17orf112F2Z3M2 114 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 HAX1O00165 279 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 GGCTO75223 188 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 CD28P10747 220 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 ZP3P21754 424 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 RPL29P47914 159 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 OPCMLQ14982 345 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 Q56UQ5 140 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 BTNL8Q6UX41 500 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 ZNF600Q6ZNG1 722 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 GINS3Q9BRX5 216 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 ZNF747Q9BV97 191 aa9.31□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 AGPAT2O15120 278 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 OR2C1O95371 312 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 TOMM40O96008 361 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 TPT1P13693 172 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 GPR183P32249 361 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 ARL3P36405 182 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 CAMLGP49069 296 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 PLP1P60201 277 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 SERF2P84101 59 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 CLEC19AQ6UXS0 136 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 GPHB5Q86YW7 130 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 ZNF709Q8N972 641 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 OR2G3Q8NGZ4 309 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 MGST2Q99735 147 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 NPCDR1Q9BY65 106 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 SMIM3Q9BZL3 60 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 GNB4Q9HAV0 340 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 SLC45A2Q9UMX9 530 aa9.3□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 OR2T8A6NH00 312 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 NDUFA4O00483 81 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 SEC11BP0C7V7 166 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 FGF7P21781 194 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 S100A7P31151 101 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 ADMP35318 185 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 PRR20EP86478 221 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 PRR20CP86479 221 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 PRR20DP86480 221 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 PRR20BP86481 221 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 PRR20AP86496 221 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 FHL3Q13643 280 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 LCNL1Q6ZST4 164 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 S100A7AQ86SG5 101 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 BAP18Q8IXM2 172 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 BPIFCQ8NFQ6 507 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 Q8WTZ3 238 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 PHYHIPLQ96FC7 376 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 GGTLC1Q9BX51 225 aa9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 LINC01619G3V211 115 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 LGALS9O00182 355 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 BMPR1BO00238 502 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 IGHV3-11P01762 117 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 IGHV3-48P01763 117 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 MBP02144 154 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 RD3LP0DJH9 198 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 SPP1P10451 314 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 ELLP55199 621 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 KRTAP10-3P60369 221 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 ZNF616Q08AN1 781 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 SHISA2Q6UWI4 295 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 OR51G1Q8NGK1 321 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 CHRDL1Q9BU40 450 aa9.28□□□□□ -0.92
HDLBP-215ENST00000427487 RNF24Q9Y225 148 aa9.28□□□□□ -0.92
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