RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390935.1

RNA5SP18-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 18, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP18, Length 121 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP18-201ENST00000390935 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa5.71□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 V9GYH0 126 aa5.71□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 ALMS1Q8TCU4 4167 aa5.7□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa5.7□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa5.7□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 A0A1W2PS18 150 aa5.7□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 MPTX1A8MV57 137 aa5.7□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 IFNA10P01566 189 aa5.7□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 IGLC1P0CG04 106 aa5.7□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 SLC25A4P12235 298 aa5.7□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 NPY1RP25929 384 aa5.7□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 CRYBB3P26998 211 aa5.7□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 OR10J1P30954 320 aa5.7□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 P2RY1P47900 373 aa5.7□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 CCR6P51684 374 aa5.7□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 DEFB131AP59861 70 aa5.7□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 TNFRSF9Q07011 255 aa5.7□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 PMS2P11Q13670 270 aa5.7□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 SMCO1Q147U7 214 aa5.7□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 ZNF79Q15937 498 aa5.7□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 TMED4Q7Z7H5 227 aa5.7□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 TOMM5Q8N4H5 51 aa5.7□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 OR1S2Q8NGQ3 325 aa5.7□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 NPIPB3Q92617 1050 aa5.7□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 TRIM63Q969Q1 353 aa5.7□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 RBKSQ9H477 322 aa5.7□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 TMEM231Q9H6L2 316 aa5.7□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 HSPB7Q9UBY9 170 aa5.7□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 RABAC1Q9UI14 185 aa5.7□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 CXorf65A6NEN9 183 aa5.69□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 K7EQG2 157 aa5.69□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 SCGB2A1O75556 95 aa5.69□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 ANXA3P12429 323 aa5.69□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 S100A5P33763 92 aa5.69□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 FAUP35544 74 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 SRPXP78539 464 aa5.69□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 TMEM128Q5BJH2 165 aa5.69□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 ETFRF1Q6IPR1 90 aa5.69□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 CCDC190Q86UF4 302 aa5.69□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 LGI3Q8N145 548 aa5.69□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 STXBP6Q8NFX7 210 aa5.69□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 OR1S1Q8NH92 325 aa5.69□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 DTD1Q8TEA8 209 aa5.69□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 Q8WTZ3 238 aa5.69□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 ACY3Q96HD9 319 aa5.69□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 CACFD1Q9UGQ2 172 aa5.69□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 U3KQ87 197 aa5.69□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 U3KQE9 123 aa5.69□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 TRAV2A0A0B4J234 112 aa5.68□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 PITX3O75364 302 aa5.68□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 JTBO76095 146 aa5.68□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 IFNA4P05014 189 aa5.68□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 IL4P05112 153 aa5.68□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP5.68□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 RD3LP0DJH9 198 aa5.68□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 VAMP1P23763 118 aa5.68□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 AP3S2P59780 193 aa5.68□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 C16orf54Q6UWD8 224 aa5.68□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 NOXA1Q86UR1 476 aa5.68□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 OR11H2Q8NH07 326 aa5.68□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 DCANP1Q8TF63 244 aa5.68□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 GRAMD2BQ96HH9 432 aa5.68□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 RARRES2Q99969 163 aa5.68□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 KMT2AQ03164 3969 aa5.68□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 KNCNA6PVL3 124 aa5.67□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 DEFB4AO15263 64 aa5.67□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 BUB3O43684 328 aa5.67□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 SFT2D2O95562 160 aa5.67□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 TOMM40O96008 361 aa5.67□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 CA1P00915 261 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 ZNF688P0C7X2 276 aa5.67□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 IAPPP10997 89 aa5.67□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 PSG1P11464 419 aa5.67□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 ZNF90Q03938 601 aa5.67□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 DHRS2Q13268 280 aa5.67□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 PPP1R1AQ13522 171 aa5.67□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 GAMTQ14353 236 aa5.67□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 BAK1Q16611 211 aa5.67□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 STHQ8IWL8 128 aa5.67□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 LRTM2Q8N967 370 aa5.67□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 OR51G1Q8NGK1 321 aa5.67□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 GATAD1Q8WUU5 269 aa5.67□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 GLMPQ8WWB7 406 aa5.67□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 SRRQ9GZT4 340 aa5.67□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa5.66□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa5.66□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 NUPR2A6NF83 97 aa5.66□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 HELTA6NFD8 242 aa5.66□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 ZFP92A6NM28 416 aa5.66□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 HOXB5P09067 269 aa5.66□□□□□ -1.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 373.9 ms