RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 WIPF1O43516 503 aa15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRAF2O60831 178 aa15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 SCGB1D2O95969 90 aa15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 CTSGP08311 255 aa15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM106AQ4KMX7 169 aa15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 SPSB3Q6PJ21 355 aa15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 NOXA1Q86UR1 476 aa15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 C5orf51A6NDU8 294 aa15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 GNG7O60262 68 aa15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 INSL3P51460 131 aa15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa15.97■□□□□ 0.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
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CCNDBP1-208ENST00000566515 PTTG1O95997 202 aa15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 CSN3P07498 182 aa15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 HAPLN4Q86UW8 402 aa15.96■□□□□ 0.15
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CCNDBP1-208ENST00000566515 PALMDQ9NP74 551 aa15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 PEMTQ9UBM1 199 aa15.96■□□□□ 0.15
CCNDBP1-208ENST00000566515 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
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CCNDBP1-208ENST00000566515 LGALS9O00182 355 aa15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 SSSCA1O60232 199 aa15.95■□□□□ 0.14
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CCNDBP1-208ENST00000566515 EDN2P20800 178 aa15.95■□□□□ 0.14
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CCNDBP1-208ENST00000566515 REC114Q7Z4M0 266 aa15.95■□□□□ 0.14
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CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM50AO95807 157 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 MBPP02686 304 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
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CCNDBP1-208ENST00000566515 GSG1LQ6UXU4 331 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 OR4X1Q8NH49 305 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 C2orf50Q96LR7 162 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 C2orf70A6NJV1 201 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 TM4SF20Q53R12 229 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRSS54Q6PEW0 395 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF414Q96IQ9 312 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 GOSR2O14653 212 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 CLN5O75503 358 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 RND2P52198 227 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 RAB11AP62491 216 aa15.92■□□□□ 0.14
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CCNDBP1-208ENST00000566515 CD69Q07108 199 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 ETFRF1Q6IPR1 90 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 CACNG8Q8WXS5 425 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 PSENENQ9NZ42 101 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM213A2RRL7 107 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 NDUFA4O00483 81 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 SIX6O95475 246 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC25A4P12235 298 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 FOLR2P14207 255 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 PAX9P55771 341 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 RELQ04864 619 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC16A13Q7RTY0 426 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM190Q8WZ59 177 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 C20orf24Q9BUV8 137 aa15.91■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
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CCNDBP1-208ENST00000566515 A8MWP6 167 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 LY86O95711 162 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 IGLV1-51P01701 117 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM116Q8NCL8 245 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 NPIPB3Q92617 1050 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 ACY3Q96HD9 319 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 SMIM8Q96KF7 97 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 SORL1Q92673 2214 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 SSNA1O43805 119 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 YIF1AO95070 293 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 CBLN1P23435 193 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 RAB40CQ96S21 281 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 UFC1Q9Y3C8 167 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 SELENOKQ9Y6D0 94 aa15.9■□□□□ 0.14
CCNDBP1-208ENST00000566515 K7EPK0 472 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 TIGITQ495A1 244 aa15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 C7orf66A4D0T2 115 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 IL15RAQ13261 267 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 GAMTQ14353 236 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 RGS21Q2M5E4 152 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 DYNLRB2Q8TF09 96 aa15.88■□□□□ 0.13
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRR25Q96S07 402 aa15.88■□□□□ 0.13
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