RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		16.19	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		16.19	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	16.19	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM50A	O95807	157 aa		16.19	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		16.19	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		16.19	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	16.19	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	16.19	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200	CACNG5	Q9UF02	275 aa		16.19	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200		V9GYH0	126 aa		16.19	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		16.18	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM187	Q14656	261 aa		16.18	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200	MLANA	Q16655	118 aa		16.18	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200	IL22RA2	Q969J5	263 aa		16.18	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM63	Q969Q1	353 aa		16.18	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200	ENY2	Q9NPA8	101 aa		16.18	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		16.17	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4C46	A6NHA9	309 aa		16.17	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	16.17	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	16.17	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		16.17	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		16.17	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		16.17	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		16.17	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200	MCUB	Q9NWR8	336 aa		16.17	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		16.17	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	16.16	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4X1	Q8NH49	305 aa		16.16	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200	PRR13	Q9NZ81	148 aa		16.16	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A1B0GU03	582 aa		16.15	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200	CLN5	O75503	358 aa		16.15	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200	HTR2B	P41595	481 aa		16.15	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF79	Q15937	498 aa		16.15	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		16.15	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		16.15	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200	GINS3	Q9BRX5	216 aa		16.15	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200	VSIR	Q9H7M9	311 aa		16.15	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		16.15	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	16.15	■□□□□ 0.18
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		16.14	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		16.14	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	OPRK1	P41145	380 aa		16.14	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	NMS	Q5H8A3	153 aa		16.14	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		16.14	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	16.13	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	C2orf83	Q53S99	150 aa		16.13	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	LILRB2	Q8N423	598 aa		16.13	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	16.13	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A0B4J2A0	478 aa		16.12	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	IGKV1-17	P01599	117 aa		16.12	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	AKR1C4	P17516	323 aa		16.12	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	PYDC2	Q56P42	97 aa		16.12	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC190	Q86UF4	302 aa		16.12	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	ST8SIA2	Q92186	375 aa		16.12	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		16.12	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC160	A6NGH7	325 aa		16.11	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	16.11	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		16.11	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		16.11	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		16.11	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		16.11	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	CEBPZOS	A8MTT3	80 aa		16.11	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	CD5	P06127	495 aa		16.11	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	16.11	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		16.11	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200		Q6ZWC4	215 aa		16.11	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	TCF24	Q7RTU0	167 aa		16.11	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		16.11	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		16.11	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	16.11	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		16.1	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		16.1	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	S100A5	P33763	92 aa		16.1	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	CCR6	P51684	374 aa		16.1	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	APOC4	P55056	127 aa		16.1	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	AP3S2	P59780	193 aa		16.1	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		16.1	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		16.1	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		16.1	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		16.1	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		16.1	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		16.09	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		16.09	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	UBE2C	O00762	179 aa		16.09	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	NXPH3	O95157	252 aa		16.09	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	IGLC1	P0CG04	106 aa		16.09	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	BMI1	P35226	326 aa		16.09	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	TFPI2	P48307	235 aa		16.09	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	TNFRSF9	Q07011	255 aa		16.09	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	SMCO1	Q147U7	214 aa		16.09	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		16.09	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		16.09	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	LGI3	Q8N145	548 aa		16.09	■□□□□ 0.17
PPP4C-205	ENST00000563200	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		16.08	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	LCE6A	A0A183	80 aa		16.08	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	DFFB	O76075	338 aa		16.08	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	ANXA3	P12429	323 aa		16.08	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	CRYBB3	P26998	211 aa		16.08	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	SRPX	P78539	464 aa		16.08	■□□□□ 0.16
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF124	Q15973	351 aa		16.08	■□□□□ 0.16

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