RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555658.5

FOXN3-210, Transcript of forkhead box N3, humanhuman

TSL 3

Gene FOXN3, Length 648 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-210ENST00000555658 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 A0A1W2PPE3 182 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 TMEM218A2RU14 115 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 COLCA2A8K830 154 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 FAM157AC9JC47 383 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 J3QLI3 93 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 K7ERU9 68 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP3.3□□□□□ -1.883e-9■■■■■ 45.5
FOXN3-210ENST00000555658 FCGR3BO75015 233 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 OR2A4O95047 310 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 CDS2O95674 445 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 IGLV1-47P01700 117 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 IGHG4P01861 327 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 APOA2P02652 100 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 ARG1P05089 322 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 CRYGBP07316 175 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 MSMBP08118 114 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 GIPP09681 153 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 SULT1A3P0DMM9 295 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 SULT1A4P0DMN0 295 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 VDAC1P21796 283 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 COX7A1P24310 79 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 HTR1DP28221 377 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 KIR2DS2P43631 304 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 LPAR6P43657 344 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 ERVK-16P61578 105 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 RANP62826 216 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 DLK1P80370 383 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 PAX2Q02962 417 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 PAX8Q06710 450 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 UBE2V1Q13404 147 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 TMEM187Q14656 261 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 RTL8BQ17RB0 113 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 ANKRD55Q3KP44 614 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 RPL39P5Q59GN2 51 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 TMEM268Q5VZI3 342 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 FAM71F2Q6NXP2 309 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 UQCC3Q6UW78 93 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 Q6ZSV7 163 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 VMO1Q7Z5L0 202 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 SVBPQ8N300 66 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 PNKDQ8N490 385 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 Q8N7P7 452 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 C15orf54Q8N8G6 183 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 LRTM2Q8N967 370 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 OR11H6Q8NGC7 330 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 OR11H7Q8NGC8 314 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 RXFP4Q8TDU9 374 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 LHX4Q969G2 390 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 PTH2Q96A98 100 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 RPEQ96AT9 228 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 C2orf50Q96LR7 162 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 OR2A7Q96R45 310 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 TP53RKQ96S44 253 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 SPIN2AQ99865 258 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 FOXC2Q99958 501 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 CHIAQ9BZP6 476 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 SIRPDQ9H106 197 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 PLEKHA2Q9HB19 425 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 MMP26Q9NRE1 261 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 DPM3Q9P2X0 92 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 CACFD1Q9UGQ2 172 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 INSIG2Q9Y5U4 225 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 LRBAP50851 2863 aa3.3□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 BSNQ9UPA5 3926 aa3.29□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 A0A1B0GU03 582 aa3.29□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 OOSP1A8MZH6 123 aa3.29□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 SEC14L6B5MCN3 397 aa3.29□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 TEX46H3BTG2 121 aa3.29□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 M0QXV9 152 aa3.29□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 CCL25O15444 150 aa3.29□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 SIX6O95475 246 aa3.29□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 HPRT1P00492 218 aa3.29□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 HRASP01112 189 aa3.29□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 KRASP01116 189 aa3.29□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 APOC3P02656 99 aa3.29□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 CT45A6P0DMU7 189 aa3.29□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 CT45A5P0DMU8 189 aa3.29□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 CT45A7P0DMV0 189 aa3.29□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 CXCL3P19876 107 aa3.29□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 FGF7P21781 194 aa3.29□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 S100A2P29034 98 aa3.29□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 S100A7P31151 101 aa3.29□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 BRS3P32247 399 aa3.29□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 DUTP33316 252 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 AMTP48728 403 aa3.29□□□□□ -1.88
FOXN3-210ENST00000555658 UBE2E1P51965 193 aa3.29□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.6 ms