RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516228.1

RNU6-162P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 162, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-162P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-162P-201ENST00000516228 GPX8Q8TED1 209 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 RASD2Q96D21 266 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 GPER1Q99527 375 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 CCL13Q99616 98 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 ANAPC10Q9UM13 185 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 ERBINQ96RT1 1412 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 INSRP06213 1382 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 GPRASP1Q5JY77 1395 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 PKD1L2Q7Z442 2459 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 TAF1LQ8IZX4 1826 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 I3L521 148 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 COX7A2LO14548 114 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 SNAP29O95721 258 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 NMBP08949 121 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 CD79AP11912 226 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 XIAPP98170 497 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 Q5XG85 94 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 TMEM53Q6P2H8 277 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 DDI1Q8WTU0 396 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 H7BYZ3 331 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 FABP7O15540 132 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 TNFP01375 233 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 EVI2AP22794 236 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 OR2Y1Q8NGV0 311 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 OR2AE1Q8NHA4 323 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 BEX2Q9BXY8 128 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 LYRM4Q9HD34 91 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 TERF2IPQ9NYB0 399 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 IL36BQ9NZH7 164 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 OPTCQ9UBM4 332 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 AK3Q9UIJ7 227 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 OR52A1Q9UKL2 312 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 SBF1O95248 1867 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 TOPBP1Q92547 1522 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 CHD7Q9P2D1 2997 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 CXCL11O14625 94 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 SULT1C4O75897 302 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 APOMO95445 188 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 PPP1R1AQ13522 171 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 TRAM1Q15629 374 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 KISS1Q15726 138 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 LINC00299Q6ZSB3 139 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 OR4A15Q8NGL6 344 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 MCFD2Q8NI22 146 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 LYSTQ99698 3801 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 COMMD9Q9P000 198 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 GCNT4Q9P109 453 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 EYSQ5T1H1 3165 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 CFAP46Q8IYW2 2715 aa-2.64□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 TRAV10A0A0B4J240 114 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 GOLGA8IPA6NC78 632 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 EFCAB9A8MZ26 197 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 M0R2T5 61 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 ARL6IP5O75915 188 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 GP1BAP07359 652 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 SRP19P09132 144 aaKnown RBP-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 LCN2P80188 198 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 GNA13Q14344 377 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF56Q15929 161 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 EXOC3L4Q17RC7 722 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 ESRGQ1W209 222 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 SPANXN3Q5MJ09 141 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 SPANXN2Q5MJ10 180 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 OR6K2Q8NGY2 324 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 GPR84Q9NQS5 396 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 TAS2R13Q9NYV9 303 aa-2.65□□□□□ -2.83
RNU6-162P-201ENST00000516228 TRAV3A0A0B4J244 114 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 PQLC2LA1A4F0 135 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 PRM2P04554 102 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 PDE6GP18545 87 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 BEX3Q00994 111 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 FABP5Q01469 135 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 RAB11BQ15907 218 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 OR13D1Q8NGV5 346 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 MRAP2Q96G30 205 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 CLEC2DQ9UHP7 191 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 CXCL8P10145 99 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 IFITM2Q01629 132 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 ACTL10Q5JWF8 245 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 C4orf22Q6V702 233 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 MIR17HGQ75NE6 70 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 CYTH2Q99418 400 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 CIB1Q99828 191 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 BBS2Q9BXC9 721 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 SLC22A4Q9H015 551 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-162P-201ENST00000516228 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP-2.67□□□□□ -2.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95.9 ms