RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 C8orf88P0DMB2 117 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-219ENST00000550655 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
CS-219ENST00000550655 ERHP84090 104 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
CS-219ENST00000550655 PVRIGQ6DKI7 326 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-219ENST00000550655 FAM219AQ8IW50 185 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-219ENST00000550655 UBAC2Q8NBM4 344 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-219ENST00000550655 UXS1Q8NBZ7 420 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-219ENST00000550655 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
CS-219ENST00000550655 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
CS-219ENST00000550655 GALNT14Q96FL9 552 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-219ENST00000550655 PALMDQ9NP74 551 aa13.36□□□□□ -0.27
CS-219ENST00000550655 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa13.36□□□□□ -0.27
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CS-219ENST00000550655 IFNA17P01571 189 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-219ENST00000550655 CTSGP08311 255 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-219ENST00000550655 ETV6P41212 452 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-219ENST00000550655 ELLP55199 621 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
CS-219ENST00000550655 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
CS-219ENST00000550655 TMEM187Q14656 261 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-219ENST00000550655 Q56UQ5 140 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-219ENST00000550655 TMEM268Q5VZI3 342 aa13.35□□□□□ -0.27
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CS-219ENST00000550655 TMEM61Q8N0U2 210 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-219ENST00000550655 MARC2Q969Z3 335 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-219ENST00000550655 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-219ENST00000550655 PDCD10Q9BUL8 212 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-219ENST00000550655 PRR13Q9NZ81 148 aa13.35□□□□□ -0.27
CS-219ENST00000550655 UFC1Q9Y3C8 167 aa13.35□□□□□ -0.27
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CS-219ENST00000550655 CD7P09564 240 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-219ENST00000550655 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
CS-219ENST00000550655 FAUP35544 74 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
CS-219ENST00000550655 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
CS-219ENST00000550655 AP3S2P59780 193 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-219ENST00000550655 CD81P60033 236 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-219ENST00000550655 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
CS-219ENST00000550655 TOMM5Q8N4H5 51 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-219ENST00000550655 GPR146Q96CH1 333 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-219ENST00000550655 SCGB3A2Q96PL1 93 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-219ENST00000550655 SRRQ9GZT4 340 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-219ENST00000550655 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
CS-219ENST00000550655 CACNG5Q9UF02 275 aa13.34□□□□□ -0.27
CS-219ENST00000550655 MFAP4P55083 255 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 GUCA2BQ16661 112 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 BSXQ3C1V8 233 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 OR52E5Q8NH55 327 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 IL22RA2Q969J5 263 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 TXN2Q99757 166 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 NEURL2Q9BR09 285 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 TM2D3Q9BRN9 247 aa13.33□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 SNCAP37840 140 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 SPCS3P61009 180 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 DEDD2Q8WXF8 326 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 WFDC10AQ9H1F0 79 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa13.32□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 AKR1C4P17516 323 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 SPANXN2Q5MJ10 180 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 RCHY1Q96PM5 261 aa13.31□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 K7EMT4 169 aa13.3□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 RELQ04864 619 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 NMSQ5H8A3 153 aa13.3□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 C20orf24Q9BUV8 137 aa13.3□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 ENY2Q9NPA8 101 aa13.3□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 TRAV25A0A0B4J276 109 aa13.29□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 A0A0B4J2A0 478 aa13.29□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 C15orf62A8K5M9 175 aa13.29□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 CORTO00230 105 aa13.29□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 GNG7O60262 68 aa13.29□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP13.29□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 HAGHQ16775 308 aa13.29□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 LYZL2Q7Z4W2 148 aa13.29□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 TMED4Q7Z7H5 227 aa13.29□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 DEFB125Q8N687 156 aa13.29□□□□□ -0.28
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CS-219ENST00000550655 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 TUBA4BQ9H853 241 aa13.29□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 SHPKQ9UHJ6 478 aa13.29□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 NXPH3O95157 252 aa13.28□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 SULT1A3P0DMM9 295 aa13.28□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 SULT1A4P0DMN0 295 aa13.28□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 BAK1Q16611 211 aa13.28□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 ZMAT4Q9H898 229 aa13.28□□□□□ -0.28
CS-219ENST00000550655 OR11H12B2RN74 326 aa13.27□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 ANXA3P12429 323 aa13.27□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 HTR2BP41595 481 aa13.27□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 NPBWR1P48145 328 aa13.27□□□□□ -0.29
CS-219ENST00000550655 SRPXP78539 464 aa13.27□□□□□ -0.29
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