RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513398.1

ACTN3-203, Transcript of actinin alpha 3 (gene/pseudogene), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTN3, Length 2,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3-203ENST00000513398 CHD6Q8TD26 2715 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 DUTP33316 252 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 ERVK-16P61578 105 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 STPG3Q8N7X2 389 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 SLC35E1Q96K37 410 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 SLC35B1P78383 322 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 Q8TCH9 128 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 LY96Q9Y6Y9 160 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 TRAV3A0A0B4J244 114 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 M0R1X1 148 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 GNG4P50150 75 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 CENPWQ5EE01 88 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 TXN2Q99757 166 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 NPVFQ9HCQ7 196 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 IQCF6A8MYZ5 107 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 SPINT2O43291 252 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 PCP4P48539 62 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 TCL1AP56279 114 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 RPL19P84098 196 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 EDDM3AQ14507 147 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 AARDQ4LEZ3 155 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 SLC45A2Q9UMX9 530 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 MT-ND6P03923 174 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 CTRLP40313 264 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 SPRNQ5BIV9 151 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 ACP7Q6ZNF0 438 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 NEUROG1Q92886 237 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 C1orf159Q96HA4 380 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 KCNS1Q96KK3 526 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 RCHY1Q96PM5 261 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 ZNF835Q9Y2P0 537 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 C16orf97H3BN30 126 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 J3QW42 95 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 ZNF253O75346 499 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 PROP1O75360 226 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 FXYD3Q14802 87 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 WDR73Q6P4I2 378 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 GNG12Q9UBI6 72 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 UQCR10Q9UDW1 63 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 TCF19Q9Y242 345 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 ACTL6BO94805 426 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 TEPPQ6URK8 271 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 Q6ZN92 141 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ACTN3-203ENST00000513398 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 PQLC2Q6ZP29 291 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 STPG4Q8N801 248 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 A0A1W2PS18 150 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 HELTA6NFD8 242 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 IGHV3-13P01766 116 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 IGHV3-7P01780 117 aa14.64□□□□□ -0.07
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ACTN3-203ENST00000513398 CX3CL1P78423 397 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 RELBQ01201 579 aa14.64□□□□□ -0.07
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ACTN3-203ENST00000513398 C11orf53Q8IXP5 236 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 OR52E5Q8NH55 327 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 MIR17HGQ75NE6 70 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 TMEM140Q9NV12 185 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 CSMD1Q96PZ7 3565 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 TRAV34A0A0B4J273 112 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 HYPMO75409 117 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 ADH4P08319 380 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 IGLC2P0DOY2 106 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 IGLC3P0DOY3 106 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 GNLYP22749 145 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 SRIP30626 198 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 RAB31Q13636 194 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 PSG5Q15238 335 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 RPL39P5Q59GN2 51 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 TIMM23BQ5SRD1 257 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 SPRY3O43610 288 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 OR5G3P0C626 314 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 OR2Z1Q8NG97 314 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 C15orf65H3BRN8 121 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 TIGITQ495A1 244 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 TUBG2Q9NRH3 451 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 C3orf79P0CE67 100 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 AREGP15514 252 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 IGFBP2P18065 325 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 NPY1RP25929 384 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 BSPH1Q075Z2 132 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 WDR82Q6UXN9 313 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 WNT10AQ9GZT5 417 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 THBDP07204 575 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 NTF3P20783 257 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 FAM19A2Q8N3H0 131 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 S1PR3Q99500 378 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN3-203ENST00000513398 CXXC4Q9H2H0 198 aa14.61□□□□□ -0.07
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