RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477970.1

PTPRF-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRF, Length 3,321 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-212ENST00000477970 CST9LP1Q5W188 147 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 PQLC2Q6ZP29 291 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 CRYGBP07316 175 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 KCNIP4Q6PIL6 250 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 SLC16A13Q7RTY0 426 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 THAP8Q8NA92 274 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 HINT2Q9BX68 163 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 PSMB11A5LHX3 300 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 NDUFB4O95168 129 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 TRGC1P0CF51 173 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 GNLYP22749 145 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 PRRX1P54821 245 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 TAS2R45P59539 299 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 FOXL1Q12952 345 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 DNLZQ5SXM8 178 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 MUC15Q8N387 334 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 UHRF2Q96PU4 802 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 ZGRF1Q86YA3 2104 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 UBE2G2P60604 165 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 OR4P4Q8NGL7 312 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 FRZBQ92765 325 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 RNF5Q99942 180 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF462Q96JM2 2506 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 SIAH2O43255 324 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 PLCE1Q9P212 2302 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 NDUFA6P56556 154 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 C4orf17Q53FE4 359 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 LY6G5BQ8NDX9 201 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 IFITM10A6NMD0 228 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 PLAUP00749 431 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 OR10J1P30954 320 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 WT1-ASQ06250 92 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 FAM78BQ5VT40 261 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 OR10W1Q8NGF6 305 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 OR2T10Q8NGZ9 312 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 MIR17HGQ75NE6 70 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 HIST3H2BBQ8N257 126 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 MIOXQ9UGB7 285 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 PITPNC1Q9UKF7 332 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 SCO2A0A1W2PP80 73 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 PPP5D1E7EU14 171 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 CCL21O00585 134 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 CRYGCP07315 174 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 UQCRFS1P47985 274 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 REG1BP48304 166 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 SELENOTP62341 195 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 ADORA2A-AS1P86434 159 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 ACTL10Q5JWF8 245 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 ETFRF1Q6IPR1 90 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 MMD2Q8IY49 270 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 OR4X1Q8NH49 305 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 LINC01560Q8TB33 94 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 SFRP2Q96HF1 295 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 CLEC7AQ9BXN2 247 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 A0A1W2PRE2 83 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 ZNF503Q96F45 646 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 ACY3Q96HD9 319 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 PFDN5Q99471 154 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 SLC25A33Q9BSK2 321 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRF-212ENST00000477970 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRF-212ENST00000477970 E7EUB6 86 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRF-212ENST00000477970 LY6LH3BQJ8 138 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRF-212ENST00000477970 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRF-212ENST00000477970 FOXH1O75593 365 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRF-212ENST00000477970 C8orf88P0DMB2 117 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRF-212ENST00000477970 COL8A2P25067 703 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRF-212ENST00000477970 OR1L4Q8NGR5 311 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRF-212ENST00000477970 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRF-212ENST00000477970 DERL1Q9BUN8 251 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRF-212ENST00000477970 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRF-212ENST00000477970 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRF-212ENST00000477970 FAM90A27PA6NNH2 459 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRF-212ENST00000477970 PRSS47A8MTI9 375 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRF-212ENST00000477970 COMPP49747 757 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRF-212ENST00000477970 PDLIM4P50479 330 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRF-212ENST00000477970 PRSS8Q16651 343 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRF-212ENST00000477970 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRF-212ENST00000477970 C11orf71Q6IPW1 123 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRF-212ENST00000477970 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRF-212ENST00000477970 A0A1W2PPI3 338 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRF-212ENST00000477970 IGLC7A0M8Q6 106 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRF-212ENST00000477970 CORTO00230 105 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRF-212ENST00000477970 OR10J4P0C629 311 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRF-212ENST00000477970 MOB3BQ86TA1 216 aa9.82□□□□□ -0.84
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