RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 Q56UQ5 140 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM128Q5BJH2 165 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 UBAC2Q8NBM4 344 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 IZUMO1RA6ND01 250 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 F8W735 103 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 MT-CO2P00403 227 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 MFAP4P55083 255 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 DEFB114Q30KQ6 69 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 TM4SF20Q53R12 229 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 LCN12Q6JVE5 192 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 SPSB3Q6PJ21 355 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 LYZL2Q7Z4W2 148 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 LGI3Q8N145 548 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 OR2K2Q8NGT1 345 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 CHRDL1Q9BU40 450 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A0B4J2A0 478 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 NAP1L6A6NFF2 107 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 CCR6P51684 374 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 Q8N1Y9 231 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 DYNLRB2Q8TF09 96 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 TXN2Q99757 166 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 PALMDQ9NP74 551 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 SHPKQ9UHJ6 478 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 SORL1Q92673 2214 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM213A2RRL7 107 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 IGHV3-48P01763 117 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 CTSGP08311 255 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 SULT1A3P0DMM9 295 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 SULT1A4P0DMN0 295 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 SRPXP78539 464 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 PVRIGQ6DKI7 326 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 UXS1Q8NBZ7 420 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 CACNG8Q8WXS5 425 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 UFC1Q9Y3C8 167 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 DNAH9Q9NYC9 4486 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 A8MWP6 167 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 ADMP35318 185 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF785A8K8V0 405 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 CENPXA8MT69 81 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 CEBPZOSA8MTT3 80 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 IL7P13232 177 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 VAMP1P23763 118 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 ELLP55199 621 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 NMSQ5H8A3 153 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 CENPSQ8N2Z9 138 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 ASCL2Q99929 193 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 CACFD1Q9UGQ2 172 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 A6NHS1 94 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 NDUFA4O00483 81 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 NXPH3O95157 252 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 SFT2D2O95562 160 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 C8orf88P0DMB2 117 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 SMCO1Q147U7 214 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 BSXQ3C1V8 233 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKRD55Q3KP44 614 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 DUSP18Q8NEJ0 188 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 MARC2Q969Z3 335 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 MLXQ9UH92 298 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 SELENOKQ9Y6D0 94 aa15.94■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 CORTO00230 105 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 NDUFB6O95139 128 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 HTR2BP41595 481 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP1R1AQ13522 171 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 MLANAQ16655 118 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM190Q8WZ59 177 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 C20orf24Q9BUV8 137 aa15.93■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1B0GU03 582 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 GNG7O60262 68 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 NPBWR1P48145 328 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 RELQ04864 619 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 GTSCR1Q86UQ5 136 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 LRTM2Q8N967 370 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 HIPK2Q9H2X6 1198 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 FLVCR2Q9UPI3 526 aa15.92■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 K7EMT4 169 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM50AO95807 157 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 TNFRSF9Q07011 255 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 GUCA2BQ16661 112 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 CNPY1Q3B7I2 92 aa15.91■□□□□ 0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
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