RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 TRAV40A0A0B4J280 105 aa18.15■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 TEX22C9J3V5 150 aa18.15■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 RNF223E7ERA6 249 aa18.15■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 MPDU1O75352 247 aa18.15■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM11P17152 192 aa18.15■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 CD24P25063 80 aa18.15■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP18.15■□□□□ 0.54e-6■■■□□ 16.6
CAPNS1-207ENST00000589146 PXDC1Q5TGL8 231 aa18.15■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 RSG1Q9BU20 258 aa18.15■□□□□ 0.5
CAPNS1-207ENST00000589146 OR13C7P0DN81 318 aa18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 FGF7P21781 194 aa18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 PLGLAQ15195 96 aa18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM120AOSQ5T036 256 aa18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 Q6ZRG5 221 aa18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 P2RX4Q99571 388 aa18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 C1RLQ9NZP8 487 aa18.14■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 SOX15O60248 233 aa18.13■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 IGHV4-31P0DP07 118 aa18.13■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa18.13■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 CAMLGP49069 296 aa18.13■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa18.13■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 CACNG8Q8WXS5 425 aa18.13■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 NPVFQ9HCQ7 196 aa18.13■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 BPIFB3P59826 476 aa18.12■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 AANATQ16613 207 aa18.12■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 TREML4Q6UXN2 200 aa18.12■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 IL34Q6ZMJ4 242 aa18.12■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 MARC2Q969Z3 335 aa18.12■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 Q96MF0 132 aa18.12■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 CITED4Q96RK1 184 aa18.12■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 NPCDR1Q9BY65 106 aa18.12■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 FBXO7Q9Y3I1 522 aa18.12■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 RAB19A4D1S5 217 aa18.11■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 AVPP01185 164 aa18.11■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 PRH1P02810 166 aa18.11■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 GNB1P62873 340 aa18.11■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 CD69Q07108 199 aa18.11■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM249Q2WGJ8 235 aa18.11■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF562Q6V9R5 426 aa18.11■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 Q8N9W7 124 aa18.11■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 CELSR2Q9HCU4 2923 aa18.11■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa18.1■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A0U1RQK1 487 aa18.1■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 C17orf112F2Z3M2 114 aa18.1■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM213BQ8TBF2 198 aa18.1■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP18.09■□□□□ 0.491e-6■■■□□ 15.5
CAPNS1-207ENST00000589146 AREGP15514 252 aa18.09■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 FHITP49789 147 aa18.09■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 FXYD3Q14802 87 aa18.09■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM41BQ5BJD5 291 aa18.09■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 BRD3OSQ6XYD6 125 aa18.09■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM144Q7Z5S9 345 aa18.09■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 COMMD1Q8N668 190 aa18.09■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF709Q8N972 641 aa18.09■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 OR1P1Q8NH06 330 aa18.09■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 HRH4Q9H3N8 390 aa18.09■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 CR1P17927 2039 aa18.09■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 NAV2Q8IVL1 2488 aa18.08■□□□□ 0.49
CAPNS1-207ENST00000589146 SMCO3A2RU48 225 aa18.08■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 TSPAN9O75954 239 aa18.08■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 CNIH1O95406 144 aa18.08■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 TGFAP01135 160 aa18.08■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 HLA-DRB1P01911 266 aa18.08■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 MBP02144 154 aa18.08■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 PIFOQ8TCI5 191 aa18.08■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 MGST2Q99735 147 aa18.08■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 RPRMQ9NS64 109 aa18.08■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 ANKRD34BA5PLL1 514 aa18.07■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 FSHBP01225 129 aa18.07■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 OPRK1P41145 380 aa18.07■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 CX3CL1P78423 397 aa18.07■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 TEPPQ6URK8 271 aa18.07■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 UQCC3Q6UW78 93 aa18.07■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC16A13Q7RTY0 426 aa18.07■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 SSMEM1Q8WWF3 244 aa18.07■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 KCNIP2Q9NS61 270 aa18.07■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 POLQO75417 2590 aa18.07■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa18.06■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 TEX46H3BTG2 121 aa18.06■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 CORTO00230 105 aa18.06■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 PLXNB1O43157 2135 aa18.06■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 CRYGCP07315 174 aa18.06■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 MFAP2P55001 183 aa18.06■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF616Q08AN1 781 aa18.06■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 GAMTQ14353 236 aa18.06■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 ACSM6Q6P461 480 aa18.06■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa18.06■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 MBD3L1Q8WWY6 194 aa18.06■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 FOXC2Q99958 501 aa18.06■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 GGTLC1Q9BX51 225 aa18.06■□□□□ 0.48
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM96BQ9Y3D0 163 aa18.06■□□□□ 0.48
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