RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 SLC25A24Q6NUK1 477 aa8.16□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 Q8N402 240 aa8.16□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa8.16□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 OR4A16Q8NH70 328 aa8.16□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa8.16□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF414Q96IQ9 312 aa8.16□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 TSC22D3Q99576 134 aa8.16□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 PRRT1Q99946 306 aa8.16□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 ELOVL1Q9BW60 279 aa8.16□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 SRRQ9GZT4 340 aa8.16□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM222Q9H0R3 208 aa8.16□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 SELENOKQ9Y6D0 94 aa8.16□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 K7EIM0 57 aa8.15□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 ST8SIA3O43173 380 aa8.15□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 GGCTO75223 188 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 GPR183P32249 361 aa8.15□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 S100A5P33763 92 aa8.15□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 ARL3P36405 182 aa8.15□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 AKR1C2P52895 323 aa8.15□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 PRCDQ00LT1 54 aa8.15□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 BAK1Q16611 211 aa8.15□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 C11orf87Q6NUJ2 197 aa8.15□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa8.15□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 OR2C3Q8N628 320 aa8.15□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 CACNG8Q8WXS5 425 aa8.15□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 FKBP11Q9NYL4 201 aa8.15□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
ATG4B-210ENST00000428861 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa8.14□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa8.14□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM213A2RRL7 107 aa8.14□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM187Q14656 261 aa8.14□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 GPHB5Q86YW7 130 aa8.14□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 Q8N1Y9 231 aa8.14□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 TOMM5Q8N4H5 51 aa8.14□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 SCARB1Q8WTV0 552 aa8.14□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 GPR146Q96CH1 333 aa8.14□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 CXorf58Q96LI9 332 aa8.14□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM56Q96MV1 263 aa8.14□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 B9D2Q9BPU9 175 aa8.14□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa8.14□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa8.14□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa8.14□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 OR2T8A6NH00 312 aa8.13□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 C2orf70A6NJV1 201 aa8.13□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 I3L2K1 104 aa8.13□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 IGHV3-48P01763 117 aa8.13□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 ADMP35318 185 aa8.13□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 TATDN3Q17R31 274 aa8.13□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 FAM209BQ5JX69 171 aa8.13□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM268Q5VZI3 342 aa8.13□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF114Q8NC26 417 aa8.13□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 OR1P1Q8NH06 330 aa8.13□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 VN1R17PQ8TDU5 208 aa8.13□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 GALNT14Q96FL9 552 aa8.13□□□□□ -1.11
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ATG4B-210ENST00000428861 PLEKHA3Q9HB20 300 aa8.13□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 C21orf62Q9NYP8 219 aa8.13□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 LGALS9O00182 355 aa8.12□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 TGOLN2O43493 480 aa8.12□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 B3GALNT1O75752 331 aa8.12□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 FOLR2P14207 255 aa8.12□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 AKR1C4P17516 323 aa8.12□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 DHODHQ02127 395 aa8.12□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 DEFB114Q30KQ6 69 aa8.12□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 AARDQ4LEZ3 155 aa8.12□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 TM4SF20Q53R12 229 aa8.12□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 SPANXN2Q5MJ10 180 aa8.12□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 PVRIGQ6DKI7 326 aa8.12□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 SLC35G3Q8N808 338 aa8.12□□□□□ -1.11
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ATG4B-210ENST00000428861 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 ASCL2Q99929 193 aa8.12□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 THYN1Q9P016 225 aa8.12□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 PEMTQ9UBM1 199 aa8.12□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 CACNG5Q9UF02 275 aa8.12□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF320A2RRD8 509 aa8.11□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF785A8K8V0 405 aa8.11□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 INS-IGF2F8WCM5 200 aa8.11□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 ATG12O94817 140 aa8.11□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 NXPH3O95157 252 aa8.11□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 MT-CO2P00403 227 aa8.11□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 IFNA17P01571 189 aa8.11□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 CBLN1P23435 193 aa8.11□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 CCR6P51684 374 aa8.11□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 ERHP84090 104 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 CD69Q07108 199 aa8.11□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 PLET1Q6UQ28 207 aa8.11□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 LYZL2Q7Z4W2 148 aa8.11□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 TMED4Q7Z7H5 227 aa8.11□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 SGPP2Q8IWX5 399 aa8.11□□□□□ -1.11
ATG4B-210ENST00000428861 UBAC2Q8NBM4 344 aa8.11□□□□□ -1.11
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