RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377904.8

ASIC3-204, Transcript of acid sensing ion channel subunit 3, human

TSL 2

Gene ASIC3, Length 2,096 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ASIC3-204	ENST00000377904	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ASIC3-204	ENST00000377904	RNF5	Q99942	180 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ASIC3-204	ENST00000377904	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ASIC3-204	ENST00000377904	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ASIC3-204	ENST00000377904	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ASIC3-204	ENST00000377904	DPM3	Q9P2X0	92 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ASIC3-204	ENST00000377904		A0A1W2PN81	502 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ASIC3-204	ENST00000377904	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ASIC3-204	ENST00000377904	CLN5	O75503	358 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ASIC3-204	ENST00000377904	CHRNA7	P36544	502 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ASIC3-204	ENST00000377904	HNF4G	Q14541	408 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ASIC3-204	ENST00000377904	RHEB	Q15382	184 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ASIC3-204	ENST00000377904	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ASIC3-204	ENST00000377904	CGB1	A6NKQ9	187 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ASIC3-204	ENST00000377904		E7EUB6	86 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ASIC3-204	ENST00000377904	AP4M1	O00189	453 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ASIC3-204	ENST00000377904	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
ASIC3-204	ENST00000377904	S100P	P25815	95 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ASIC3-204	ENST00000377904	LMO4	P61968	165 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ASIC3-204	ENST00000377904	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
ASIC3-204	ENST00000377904	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ASIC3-204	ENST00000377904	SSX7	Q7RTT5	188 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ASIC3-204	ENST00000377904	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ASIC3-204	ENST00000377904	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ASIC3-204	ENST00000377904	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
ASIC3-204	ENST00000377904	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ASIC3-204	ENST00000377904	SMCO3	A2RU48	225 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ASIC3-204	ENST00000377904	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
ASIC3-204	ENST00000377904	C1QL4	Q86Z23	238 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ASIC3-204	ENST00000377904	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ASIC3-204	ENST00000377904	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ASIC3-204	ENST00000377904	CEACAM3	P40198	252 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	PDLIM4	P50479	330 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	PSG5	Q15238	335 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	ZNF787	Q6DD87	383 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	LCN15	Q6UWW0	184 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	MMD2	Q8IY49	270 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	C1orf159	Q96HA4	380 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	MGST2	Q99735	147 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	RARRES2	Q99969	163 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		13.64	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	OPRK1	P41145	380 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	KLRD1	Q13241	179 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	PRSS8	Q16651	343 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	CCL19	Q99731	98 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	SIRPD	Q9H106	197 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	PMS2P11	Q13670	270 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		13.63	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	TIMM23	O14925	209 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	CNTFR	P26992	372 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	LCN2	P80188	198 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	WT1-AS	Q06250	92 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	HAGH	Q16775	308 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	TEPP	Q6URK8	271 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	CFHR4	Q92496	578 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	OR13C7	P0DN81	318 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	ICAM4	Q14773	271 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	KHDC3L	Q587J8	217 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		13.62	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	CYB5B	O43169	146 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	VENTX	O95231	258 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	TNC	P24821	2201 aa		13.61	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	CD69	Q07108	199 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	SLC25A22	Q9H936	323 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	OOSP1	A8MZH6	123 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	FOXH1	O75593	365 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	YIF1A	O95070	293 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	HOXA5	P20719	270 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	GNG13	Q9P2W3	67 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		13.6	□□□□□ -0.23
ASIC3-204	ENST00000377904	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		13.6	□□□□□ -0.23

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