RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249501.4

HOXD10-201, Transcript of homeobox D10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD10, Length 1,989 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10-201ENST00000249501 NDUFA3O95167 84 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 IGHV1-69P01742 117 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 OR13C7P0DN81 318 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 MDKP21741 143 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 RAB5CP51148 216 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 DLK1P80370 383 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 IGLC7A0M8Q6 106 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 MAS1LP35410 378 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 EBI3Q14213 229 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 Q8N6K4 173 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 C1orf159Q96HA4 380 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 KIAA1456Q9P272 454 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 WDR83OSQ9Y284 106 aa15.2■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 NAV2Q8IVL1 2488 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 UMAD1C9J7I0 102 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 TRIM77I1YAP6 450 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 I3L521 148 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 AVPP01185 164 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 MLANAQ16655 118 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 TREML4Q6UXN2 200 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 MARC2Q969Z3 335 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 GGACTQ9BVM4 153 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 NPCDR1Q9BY65 106 aa15.19■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 AREGP15514 252 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 TMEM11P17152 192 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 ELLP55199 621 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 C19orf35Q6ZS72 473 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 LINC01356Q8N9X3 169 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 P2RX4Q99571 388 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 A0A1B0GV50 99 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 TEX22C9J3V5 150 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 C5orf64Q2M2E5 130 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa15.18■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 TRAV20A0A0B4J274 112 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 AGPAT2O15120 278 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 TOR2AQ5JU69 321 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 ACSM6Q6P461 480 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 LYPD6BQ8NI32 183 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 RPRMQ9NS64 109 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 TIMM9Q9Y5J7 89 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 ABCA1O95477 2261 aa15.17■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 FAM106CPP0CH98 169 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 BRS3P32247 399 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 SERF2P84101 59 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 MBD6Q96DN6 1003 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 Q96MF0 132 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 A0A0U1RQK1 487 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 CNIH1O95406 144 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 MGST2Q99735 147 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 NPVFQ9HCQ7 196 aa15.16■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 AKR1C1Q04828 323 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 SSMEM1Q8WWF3 244 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 TSPAN15O95858 294 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 MFAP2P55001 183 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 RAB2AP61019 212 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 CD69Q07108 199 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 IL34Q6ZMJ4 242 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 ZNF709Q8N972 641 aa15.15■□□□□ 0.02
HOXD10-201ENST00000249501 RAB19A4D1S5 217 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXD10-201ENST00000249501 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP15.14■□□□□ 0.01
HOXD10-201ENST00000249501 TGFAP01135 160 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXD10-201ENST00000249501 GATA3P23771 443 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXD10-201ENST00000249501 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP15.14■□□□□ 0.01
HOXD10-201ENST00000249501 FXYD3Q14802 87 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXD10-201ENST00000249501 ZNF726P1Q15940 193 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXD10-201ENST00000249501 FFAR4Q5NUL3 377 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXD10-201ENST00000249501 Q8N9W7 124 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXD10-201ENST00000249501 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
HOXD10-201ENST00000249501 TMEM231Q9H6L2 316 aa15.14■□□□□ 0.01
HOXD10-201ENST00000249501 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
HOXD10-201ENST00000249501 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
HOXD10-201ENST00000249501 C17orf112F2Z3M2 114 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD10-201ENST00000249501 H2AFB1P0C5Y9 115 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD10-201ENST00000249501 IGHV4-31P0DP07 118 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD10-201ENST00000249501 GAMTQ14353 236 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD10-201ENST00000249501 TMEM41BQ5BJD5 291 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD10-201ENST00000249501 SPSB3Q6PJ21 355 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD10-201ENST00000249501 SSX7Q7RTT5 188 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD10-201ENST00000249501 ABHD5Q8WTS1 349 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD10-201ENST00000249501 LINC00052Q96N35 136 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD10-201ENST00000249501 GGTLC1Q9BX51 225 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD10-201ENST00000249501 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
HOXD10-201ENST00000249501 ZANQ9Y493 2812 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD10-201ENST00000249501 IGHV3-48P01763 117 aa15.13■□□□□ 0.01
HOXD10-201ENST00000249501 CCL20P78556 96 aa15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms