RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567329.1

USP7-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 7, human

TSL 4

Gene USP7, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP7-217	ENST00000567329	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		5.78	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		5.78	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	TCF23	Q7RTU1	214 aa		5.78	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	VASH2	Q86V25	355 aa		5.78	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	MMD2	Q8IY49	270 aa		5.78	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	ZNF114	Q8NC26	417 aa		5.78	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		5.78	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		5.78	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	OR8B2	Q96RD0	313 aa		5.78	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	TAAR6	Q96RI8	345 aa		5.78	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		5.78	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		5.78	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	PI4KA	P42356	2102 aa		5.78	□□□□□ -1.48
USP7-217	ENST00000567329	CACNA1E	Q15878	2313 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	SNURFL	B1AK76	121 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	LMO7DN	F2Z398	122 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329		K7ERU9	68 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	TNFSF12	O43508	249 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	ZIC3	O60481	467 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	TRAPPC6A	O75865	159 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	OR2J3	O76001	311 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	NXPH3	O95157	252 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	NBEAP1	P0C6P0	100 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	IER3	P46695	156 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	GABRA2	P47869	451 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	ATP5G3	P48201	142 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	CATR1	Q13166	79 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	RTL8B	Q17RB0	113 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329		Q6P435	159 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	DHRS13	Q6UX07	377 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329		Q8IYB0	196 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	BATF2	Q8N1L9	274 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	DEFB125	Q8N687	156 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	ZNF645	Q8N7E2	425 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	OR1L1	Q8NH94	360 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	TSKU	Q8WUA8	353 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	TMEM45B	Q96B21	275 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	CST9L	Q9H4G1	147 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	TMEM140	Q9NV12	185 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	LAMA5	O15230	3695 aa		5.77	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329		A0A1W2PR77	199 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	C15orf62	A8K5M9	175 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	SH2D1B	O14796	132 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	LIF	P15018	202 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	PMCH	P20382	165 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	GCHFR	P30047	84 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	CLDN18	P56856	261 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	PMP22	Q01453	160 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	TFF3	Q07654	80 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	LY6D	Q14210	128 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	DRAM1	Q8N682	238 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	SH2D2A	Q9NP31	389 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	RNF114	Q9Y508	228 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		5.76	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		5.75	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		5.75	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		5.75	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329		A0A0J9YW62	118 aa		5.75	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	ODAM	A1E959	279 aa		5.75	□□□□□ -1.49
USP7-217	ENST00000567329	ZNF716	A6NP11	495 aa		5.75	□□□□□ -1.49

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