RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616559.4

PTPRQ-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRQ, Length 8,165 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-209ENST00000616559 FCMRO60667 390 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 APCSP02743 223 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 PLP1P60201 277 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 LY6DQ14210 128 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 BSXQ3C1V8 233 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 SDHAF4Q5VUM1 108 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 ANKRD34AQ69YU3 496 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 TMEM88Q6PEY1 159 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 PAQR3Q6TCH7 311 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 BATF2Q8N1L9 274 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 ATP6V0BQ99437 205 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 TEX101Q9BY14 249 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 PARD6AQ9NPB6 346 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 CBLN4Q9NTU7 201 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 C5AR2Q9P296 337 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 X6R8D5 127 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF609O15014 1411 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 DIP2AQ14689 1571 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 FRG2CA6NGY1 282 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 F8VVB4 439 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 F8VWA3 439 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 FAM72CH0Y354 149 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 H0Y9J4 135 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 J3QKU1 62 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 NME4O00746 187 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 LRP3O75074 770 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 CBR1P16152 277 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF134P52741 427 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 UBE2D2P62837 147 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 PSG5Q15238 335 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 PSG3Q16557 428 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 C10orf113Q5VZT2 155 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 FAM72DQ6L9T8 149 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 TMEM91Q6ZNR0 172 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 SLC35E3Q7Z769 313 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 VN1R2Q8NFZ6 395 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 AQP3Q92482 292 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 CGREF1Q99674 301 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 ABCA3Q99758 1704 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 SOSTQ9BQB4 213 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 LYRM4Q9HD34 91 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 TAS2R4Q9NYW5 299 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 INSL5Q9Y5Q6 135 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 PTPRMP28827 1452 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 LTBP2Q14767 1821 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 A0A0U1RQV1 116 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 A0A1B0GV72 72 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 SOCS3O14543 225 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 NDUFB2O95178 105 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 P2RY4P51582 365 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 LY6G5CQ5SRR4 150 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 SDIM1Q6ZPB5 146 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 GCSAMQ8N6F7 178 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 NPWQ8N729 165 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 LRRC75AQ8NAA5 344 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 RASL10AQ92737 203 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 SAR1AQ9NR31 198 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 FOXJ2Q9P0K8 574 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 DMRT1Q9Y5R6 373 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 DUOX2Q9NRD8 1548 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 PREX2Q70Z35 1606 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 A0A1B0GTI1 187 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 IGLL5B9A064 214 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 BUD23O43709 281 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 YPEL1O60688 119 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 CD37P11049 281 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 NBL1P41271 181 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 RING1Q06587 406 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 MAJINQ3KP22 176 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 DCAF10Q5QP82 559 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 TEX43Q6ZNM6 134 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 TMEM54Q969K7 222 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 CHST5Q9GZS9 411 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 BCORQ6W2J9 1755 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 USP54Q70EL1 1684 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 A0A0G2JK05 382 aa1.8□□□□□ -2.12
PTPRQ-209ENST00000616559 OR11H12B2RN74 326 aa1.8□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms