RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557667.5

RBM23-233, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 1 (best)

Gene RBM23, Length 4,240 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-233	ENST00000557667	OR4A47	Q6IF82	309 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667		Q6ZPA2	131 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	CCKAR	P32238	428 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	CEBPG	P53567	150 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	FZR1	Q9UM11	496 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667		E7EQL1	145 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	CLDN34	H7C241	214 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	MEOX2	P50222	304 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	RPE	Q96AT9	228 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	HARBI1	Q96MB7	349 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	DOCK7	Q96N67	2140 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	CEP350	Q5VT06	3117 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	PDLIM4	P50479	330 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	UBE2C	O00762	179 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	CT45A6	P0DMU7	189 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	CT45A5	P0DMU8	189 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	CT45A7	P0DMV0	189 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	TXN2	Q99757	166 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	PRR13	Q9NZ81	148 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667		H0YJW9	148 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	DVL1	O14640	695 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	BTN1A1	Q13410	526 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	LRP11	Q86VZ4	500 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	DOK5	Q9P104	306 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	EFNA4	P52798	201 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	TIGIT	Q495A1	244 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667		A4D1N5	150 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	GATA3	P23771	443 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	CCL17	Q92583	94 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	NEUROG1	Q92886	237 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	PERP	Q96FX8	193 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	LCN2	P80188	198 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	NABP2	Q9BQ15	211 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	S100A12	P80511	92 aa		6.96	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		6.96	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	DPM3	Q9P2X0	92 aa		6.96	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	RAX	Q9Y2V3	346 aa		6.96	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		6.96	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		6.96	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667		C9JCJ5	164 aa		6.96	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	HTR1D	P28221	377 aa		6.96	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	BSX	Q3C1V8	233 aa		6.96	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	THAP8	Q8NA92	274 aa		6.96	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		6.96	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		6.96	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	TRGV9	Q99603	122 aa		6.96	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		6.96	□□□□□ -1.29
RBM23-233	ENST00000557667	C15orf62	A8K5M9	175 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM23-233	ENST00000557667	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
RBM23-233	ENST00000557667	OR2C1	O95371	312 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM23-233	ENST00000557667	LGALS4	P56470	323 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM23-233	ENST00000557667	OR1P1	Q8NH06	330 aa		6.96	□□□□□ -1.3
RBM23-233	ENST00000557667	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		6.96	□□□□□ -1.3

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