RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa15.43■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 CROCCP3Q8IVE0 287 aa15.43■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa15.43■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 OR13F1Q8NGS4 319 aa15.43■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 MAFIPQ8WZ33 124 aa15.43■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 UBQLN2Q9UHD9 624 aa15.43■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 DAPK2Q9UIK4 370 aa15.43■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa15.43■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 CLEC3BP05452 202 aa15.42■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 CRYGCP07315 174 aa15.42■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 VSTM2AQ8TAG5 236 aa15.42■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 LGALS14Q8TCE9 139 aa15.42■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 C5orf66Q9H5L9 145 aa15.42■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 RNF167Q9H6Y7 350 aa15.42■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 UFC1Q9Y3C8 167 aa15.42■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa15.41■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa15.41■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 E7EUB6 86 aa15.41■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 KBTBD11O94819 623 aa15.41■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 ZNF735P0CB33 412 aa15.41■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 AREGP15514 252 aa15.41■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 PSMB6P28072 239 aa15.41■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 MAS1LP35410 378 aa15.41■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 OR2B11Q5JQS5 317 aa15.41■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 KCTD9Q7L273 389 aa15.41■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 CXorf58Q96LI9 332 aa15.41■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 OR2A7Q96R45 310 aa15.41■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 RYR1P21817 5038 aa15.41■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 A0A0A6YYH2 397 aa15.4■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 SMIM30A4D0T7 59 aa15.4■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 A6NJ64 397 aa15.4■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 J3QRK9 145 aa15.4■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 DEFA4P12838 97 aa15.4■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 MYOD1P15172 320 aa15.4■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 ELLP55199 621 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 ARFRP1Q13795 201 aa15.4■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 KLK9Q2XQG4 91 aa15.4■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 Q6ZS49 121 aa15.4■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 ZNF645Q8N7E2 425 aa15.4■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa15.4■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 KLK9Q9UKQ9 250 aa15.4■□□□□ 0.06
NELFE-210ENST00000491139 A0A1B0GW64 132 aa15.39■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 MFSD2BA6NFX1 497 aa15.39■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 TSPAN4O14817 238 aa15.39■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 CTRB1P17538 263 aa15.39■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 CTRB2Q6GPI1 263 aa15.39■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 FUNDC2Q9BWH2 189 aa15.39■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 RHBDL2Q9NX52 303 aa15.39■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa15.38■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 A0A075B6Q4 140 aa15.38■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 IFNA4P05014 189 aa15.38■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 CLEC2LP0C7M8 214 aa15.38■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 GNB3P16520 340 aa15.38■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 DTYMKP23919 212 aa15.38■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 TALDO1P37837 337 aa15.38■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 RPL30P62888 115 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 PRR20EP86478 221 aa15.38■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 PRR20CP86479 221 aa15.38■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 PRR20DP86480 221 aa15.38■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 PRR20BP86481 221 aa15.38■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 PRR20AP86496 221 aa15.38■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 MXD1Q05195 221 aa15.38■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 ODF3L2Q3SX64 289 aa15.38■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 PLET1Q6UQ28 207 aa15.38■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 OR4S2Q8NH73 311 aa15.38■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 SLC25A38Q96DW6 304 aa15.38■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 ATG5Q9H1Y0 275 aa15.38■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa15.37■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 GABARAPO95166 117 aa15.37■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 GPR183P32249 361 aa15.37■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa15.37■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 GALNT14Q96FL9 552 aa15.37■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 MFFQ9GZY8 342 aa15.37■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 MAP6D1Q9H9H5 199 aa15.37■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 SPATA2Q9UM82 520 aa15.37■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 SLC22A5O76082 557 aa15.36■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 REG1AP05451 166 aa15.36■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 RPL8P62917 257 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 HACD4Q5VWC8 232 aa15.36■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 C11orf45Q8TAV5 145 aa15.36■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 ZNF502Q8TBZ5 544 aa15.36■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 SLC25A46Q96AG3 418 aa15.36■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 FBXL17Q9UF56 701 aa15.36■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 OR2W1Q9Y3N9 320 aa15.36■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 VPS13DQ5THJ4 4388 aa15.35■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa15.35■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 ALDH3B2P48448 385 aa15.35■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 IDNKQ5T6J7 187 aa15.35■□□□□ 0.05
NELFE-210ENST00000491139 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.4 ms