RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A0A6YYD4 124 aa14.01□□□□□ -0.17
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C9orf106Q8NAJ2 232 aa14.01□□□□□ -0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa14.01□□□□□ -0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HEATR5AQ86XA9 2040 aa14.01□□□□□ -0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLDN18P56856 261 aa14.01□□□□□ -0.17
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa14□□□□□ -0.17
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VOPP1Q96AW1 172 aa13.99□□□□□ -0.17
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CD99P14209 185 aa13.97□□□□□ -0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SRIP30626 198 aa13.97□□□□□ -0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PSMB2P49721 201 aa13.97□□□□□ -0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLSCR2Q9NRY7 297 aa13.97□□□□□ -0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IFNL4K9M1U5 179 aa13.96□□□□□ -0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM89BQ8N5H3 189 aa13.96□□□□□ -0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa13.96□□□□□ -0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCL3L1P16619 93 aa13.96□□□□□ -0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF841Q6ZN19 808 aa13.96□□□□□ -0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHODLQ9H9P2 273 aa13.96□□□□□ -0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM106CPP0CH98 169 aa13.96□□□□□ -0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TWIST1Q15672 202 aa13.96□□□□□ -0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCSK4Q6UW60 755 aa13.96□□□□□ -0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC00518Q8N0U6 118 aa13.96□□□□□ -0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FBLN5Q9UBX5 448 aa13.96□□□□□ -0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa13.96□□□□□ -0.18
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCNX2A6NKB5 2137 aa13.96□□□□□ -0.18
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