RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 ENKURQ8TC29 256 aa4.94□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 NEDD4LQ96PU5 975 aa4.94□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 UQCC2Q9BRT2 126 aa4.94□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 TUBA4BQ9H853 241 aa4.94□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 DIABLOQ9NR28 239 aa4.94□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa4.94□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 AK3Q9UIJ7 227 aa4.94□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 TBC1D24Q9ULP9 559 aa4.94□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 HERC2O95714 4834 aa4.93□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 H3BUA1 57 aa4.93□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 CTDSPLO15194 276 aa4.93□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 PLA2G10O15496 165 aa4.93□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 SPDEFO95238 335 aa4.93□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 CD3GP09693 182 aa4.93□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 GSTT2BP0CG30 244 aa4.93□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 APELAP0DMC3 54 aa4.93□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 CD37P11049 281 aa4.93□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 RFX2P48378 723 aa4.93□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM50BP56557 158 aa4.93□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 AP3S2P59780 193 aa4.93□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 HLA-DRB3P79483 266 aa4.93□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 P2RY14Q15391 338 aa4.93□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 DUSP18Q8NEJ0 188 aa4.93□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 NUDT10Q8NFP7 164 aa4.93□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 LGALS14Q8TCE9 139 aa4.93□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 FCAMRQ8WWV6 532 aa4.93□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 PTX4Q96A99 478 aa4.93□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 NUDT11Q96G61 164 aa4.93□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 GFI1Q99684 422 aa4.93□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM59Q9BXS4 323 aa4.93□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 LPAR5Q9H1C0 372 aa4.93□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 Q9N2K0 584 aa4.93□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 GHRLQ9UBU3 117 aa4.93□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa4.92□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 M0R1X1 148 aa4.92□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 BMPR1BO00238 502 aa4.92□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 SLC17A2O00624 439 aa4.92□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 PRH1P02810 166 aa4.92□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 CD81P60033 236 aa4.92□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 MOGAT2Q3SYC2 334 aa4.92□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM177Q53S58 311 aa4.92□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM69Q5SWH9 247 aa4.92□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 LCN12Q6JVE5 192 aa4.92□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 PLET1Q6UQ28 207 aa4.92□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 NRARPQ7Z6K4 114 aa4.92□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 GTSCR1Q86UQ5 136 aa4.92□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 PDPNQ86YL7 162 aa4.92□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 TOMM5Q8N4H5 51 aa4.92□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 OR6M1Q8NGM8 313 aa4.92□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 OR5H6Q8NGV6 325 aa4.92□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 SLC35D1Q9NTN3 355 aa4.92□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 DMRT1Q9Y5R6 373 aa4.92□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 SELENOKQ9Y6D0 94 aa4.92□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 FRAS1Q86XX4 4008 aa4.92□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 A0A0G2JLM5 398 aa4.91□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 METTL21EPA6NDL7 271 aa4.91□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 MSGN1A6NI15 193 aa4.91□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa4.91□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 GABARAPH6UMI1 98 aa4.91□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 LYRM1O43325 122 aa4.91□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 SCGNO76038 276 aa4.91□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 CNIH1O95406 144 aa4.91□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 UBBP0CG47 229 aa4.91□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 TRAPPC2P0DI81 140 aa4.91□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 TRAPPC2BP0DI82 140 aa4.91□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 ZBTB25P24278 435 aa4.91□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 CLDN12P56749 244 aa4.91□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP4.91□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 PLA2G7Q13093 441 aa4.91□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 RPEL1Q2QD12 228 aa4.91□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 C2orf76Q3KRA6 126 aa4.91□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 MOB1BQ7L9L4 216 aa4.91□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 FAM89BQ8N5H3 189 aa4.91□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 KCNG3Q8TAE7 436 aa4.91□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 LINC00476Q8WZB0 136 aa4.91□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 FAM3DQ96BQ1 224 aa4.91□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 ATG5Q9H1Y0 275 aa4.91□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 SRD5A3Q9H8P0 318 aa4.91□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa4.91□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 SDHAF2Q9NX18 166 aa4.91□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 COA4Q9NYJ1 87 aa4.91□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 RDH8Q9NYR8 311 aa4.91□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 COPZ2Q9P299 210 aa4.91□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 A0A0A6YYH2 397 aa4.9□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa4.9□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 A0A0B4J203 849 aa4.9□□□□□ -1.62
HOXD8-202ENST00000429017 HMX3A6NHT5 357 aa4.9□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 814.2 ms