RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 COQ2Q96H96 371 aa5.84□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 ARV1Q9H2C2 271 aa5.84□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 C11orf1Q9H5F2 150 aa5.84□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 M0QZ24 198 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 RAMP3O60896 148 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 CD5P06127 495 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 BMP5P22003 454 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 KRTAP1-1Q07627 177 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 ZNF266Q14584 549 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 ZNF585BQ52M93 769 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 MOB1BQ7L9L4 216 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 ABHD14BQ96IU4 210 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 ABCA4P78363 2273 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 SPRY3O43610 288 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 CXCL1P09341 107 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 RPL30P62888 115 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 CCL20P78556 96 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 TEX38Q6PEX7 206 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 COMMD1Q8N668 190 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 OR13A1Q8NGR1 328 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 Q8WTZ3 238 aa5.83□□□□□ -1.48
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HERC4-211ENST00000492996 IL19Q9UHD0 177 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 ZFP30Q9Y2G7 519 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 PRRG2O14669 202 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 EGR1P18146 543 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 TUBG1P23258 451 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 G6PCP35575 357 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 SNCAP37840 140 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 FAM27E3Q08E93 113 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 PMS2P11Q13670 270 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 SPANXN5Q5MJ07 72 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 GFRALQ6UXV0 394 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 RND1Q92730 232 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 RAB39BQ96DA2 213 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 RARRES2Q99969 163 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 FAM234AQ9H0X4 552 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 PITPNC1Q9UKF7 332 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 RNF115Q9Y4L5 304 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 SLC25A15Q9Y619 301 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 ATRXP46100 2492 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 A0A0G2JNJ9 132 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 SYNGR2O43760 224 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 PITX3O75364 302 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 GCGP01275 180 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 BRS3P32247 399 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 P2RY6Q15077 328 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 EFNB3Q15768 340 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 SMIM21Q3B7S5 101 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 SPINK9Q5DT21 86 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 C22orf34Q6ZV56 151 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 FGFRL1Q8N441 504 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 FAM210BQ96KR6 192 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 RSG1Q9BU20 258 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 Q9UFV3 132 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 PSG11Q9UQ72 335 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 WIPI2Q9Y4P8 454 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 A0A1B0GU03 582 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 NKX6-3A6NJ46 265 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 CCL25O15444 150 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 IGLV1-44P01699 117 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 CRYAAP02489 173 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 AMBPP02760 352 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 EDDM3BP56851 147 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 HAGHQ16775 308 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 OR8G2PQ6IF36 304 aa5.82□□□□□ -1.48
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HERC4-211ENST00000492996 CD177Q8N6Q3 437 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 ZNRF1Q8ND25 227 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 DEFB108BQ8NET1 73 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 MUCL1Q96DR8 90 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 OR2V2Q96R30 315 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 HES4Q9HCC6 221 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 PSENENQ9NZ42 101 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 PPIAL4AQ9Y536 164 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 C17orf98A8MV24 154 aa5.81□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 K7N7A8 449 aa5.81□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 ADH4P08319 380 aa5.81□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 KITLGP21583 273 aa5.81□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 PRDX2P32119 198 aa5.81□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 ARL16Q0P5N6 197 aa5.81□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 IL22RA2Q969J5 263 aa5.81□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 C5orf30Q96GV9 206 aa5.81□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 PBDC1Q9BVG4 233 aa5.81□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
HERC4-211ENST00000492996 CSTL1Q9H114 145 aa5.81□□□□□ -1.48
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