RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417027.1

RPS3AP9-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 9, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP9, Length 792 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP9-201ENST00000417027 SGMS2Q8NHU3 365 aa2.37□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 AP3S1Q92572 193 aa2.37□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 SFRP2Q96HF1 295 aa2.37□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 CCL13Q99616 98 aa2.37□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 SELENOSQ9BQE4 189 aa2.37□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP2.37□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 ATPIF1Q9UII2 106 aa2.37□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 HHLA2Q9UM44 414 aa2.37□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa2.37□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 GCC2Q8IWJ2 1684 aa2.37□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZBED9Q6R2W3 1325 aa2.37□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa2.37□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 MIA3Q5JRA6 1907 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 NAV2Q8IVL1 2488 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 ARHGEF5Q12774 1597 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 CD109Q6YHK3 1445 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 MIA2Q96PC5 1412 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 ABCA6Q8N139 1617 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 SVILO95425 2214 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 A8MWP6 167 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 LST1O00453 97 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 IGKV3-11P04433 115 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 CD5P06127 495 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 CST2P09228 141 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 FAM236CP0DP71 79 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 SERPINB10P48595 397 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 AKR1C2P52895 323 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 TAS2R45P59539 299 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 PSME3P61289 254 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 B2MP61769 119 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 LPCAT3Q6P1A2 487 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 AMTNQ6UX39 209 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 Q6ZQT7 251 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 LYPD6Q86Y78 171 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 GPHB5Q86YW7 130 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 C3orf22Q8N5N4 141 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR2D3Q8NGH3 330 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR5P3Q8WZ94 311 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 CNBD2Q96M20 576 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR52E6Q96RD3 313 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 NMNAT3Q96T66 252 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 TRIM4Q9C037 500 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 VCX3BQ9H321 246 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 GPR84Q9NQS5 396 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 C14orf105Q9NVL8 296 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 DOK5Q9P104 306 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 ARL5AQ9Y689 179 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 PZPP20742 1482 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 MYO10Q9HD67 2058 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 NUP188Q5SRE5 1749 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 UNC13BO14795 1591 aa2.36□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 MROH1Q8NDA8 1641 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 HFM1A2PYH4 1435 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 SCAPERQ9BY12 1400 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 SETD5Q9C0A6 1442 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 MED14O60244 1454 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 ADGRL2O95490 1459 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 CCDC141Q6ZP82 1450 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 PQLC2LA1A4F0 135 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR4C46A6NHA9 309 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 KNCNA6PVL3 124 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 A8MUN3 132 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 E5RI56 91 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 UBE2L6O14933 153 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 SERPINA7P05543 415 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 MAGEA12P43365 314 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 FOXA1P55317 472 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 RPS20P60866 119 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 HOXC5Q00444 222 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 BIKQ13323 160 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 LY6EQ16553 131 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 FAM229BQ4G0N7 80 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 LIN52Q52LA3 116 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 NOXRED1Q6NXP6 359 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 RASL11AQ6T310 242 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 ANKRD29Q8N6D5 301 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 ZNF680Q8NEM1 530 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 OR4X1Q8NH49 305 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 RPS4Y2Q8TD47 263 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 GID8Q9NWU2 228 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 VPREB3Q9UKI3 123 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 SNX12Q9UMY4 172 aa2.35□□□□□ -2.03
RPS3AP9-201ENST00000417027 ANGPT4Q9Y264 503 aa2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.3 ms