RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 MARCH3Q86UD3 253 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-204ENST00000542443 ABHD12Q8N2K0 398 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-204ENST00000542443 TMEM252Q8N6L7 170 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-204ENST00000542443 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-204ENST00000542443 OR13C9Q8NGT0 318 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-204ENST00000542443 OR2G3Q8NGZ4 309 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-204ENST00000542443 CD300LFQ8TDQ1 290 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-204ENST00000542443 GPR119Q8TDV5 335 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-204ENST00000542443 PP6455Q8WZ26 134 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-204ENST00000542443 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
TRDN-204ENST00000542443 SLAMF6Q96DU3 332 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-204ENST00000542443 BTF3L4Q96K17 158 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-204ENST00000542443 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-204ENST00000542443 TAAR6Q96RI8 345 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-204ENST00000542443 SPIN2AQ99865 258 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-204ENST00000542443 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-204ENST00000542443 KLHDC3Q9BQ90 382 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-204ENST00000542443 C20orf24Q9BUV8 137 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-204ENST00000542443 OCR1Q9BZK8 76 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-204ENST00000542443 STRADBQ9C0K7 418 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-204ENST00000542443 SH3BGRL3Q9H299 93 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-204ENST00000542443 CXXC4Q9H2H0 198 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-204ENST00000542443 LIME1Q9H400 295 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-204ENST00000542443 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-204ENST00000542443 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-204ENST00000542443 DEPPQ9NTK1 212 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-204ENST00000542443 EHFQ9NZC4 300 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-204ENST00000542443 IL36GQ9NZH8 169 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-204ENST00000542443 ANXA10Q9UJ72 324 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-204ENST00000542443 RNF115Q9Y4L5 304 aa3.97□□□□□ -1.77
TRDN-204ENST00000542443 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP3.97□□□□□ -1.77
TRDN-204ENST00000542443 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
TRDN-204ENST00000542443 DNAH12Q6ZR08 3092 aa3.96□□□□□ -1.77
TRDN-204ENST00000542443 EXPH5Q8NEV8 1989 aa3.96□□□□□ -1.77
TRDN-204ENST00000542443 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 A0A087WZY1 265 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 IGSF23A1L1A6 192 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 NPIPA2E9PIF3 369 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 ITGB1BP1O14713 200 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 CYB5BO43169 146 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 HCRTR1O43613 425 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 IGHG1P01857 330 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 RD3LP0DJH9 198 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 BCL2P10415 239 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 CD99P14209 185 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 SRP14P37108 136 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 OR3A4PP47883 348 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 SELENOTP62341 195 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 SERF2P84101 59 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 ZNF92Q03936 586 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 TLE4Q04727 773 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 PDGFRLQ15198 375 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 LPAL2Q16609 132 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 ECSCRQ19T08 205 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 NMSQ5H8A3 153 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 THEM4Q5T1C6 240 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 C1orf189Q5VU69 101 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 FBXW9Q5XUX1 488 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 TEX43Q6ZNM6 134 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 TMEM144Q7Z5S9 345 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 ZNF100Q8IYN0 542 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 SLC35G3Q8N808 338 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 OR8B12Q8NGG6 310 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 OR2V1Q8NHB1 315 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 FAM213BQ8TBF2 198 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 DOK4Q8TEW6 326 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 C11orf40Q8WZ69 217 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 OR1E3Q8WZA6 343 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 ST8SIA1Q92185 356 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 RCHY1Q96PM5 261 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 TMEM208Q9BTX3 173 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 PRO1933Q9H354 126 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 CALHM2Q9HA72 323 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 STARD5Q9NSY2 213 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 GSKIPQ9P0R6 139 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 AK3Q9UIJ7 227 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 TBX21Q9UL17 535 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 SLC7A11Q9UPY5 501 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 TIMM9Q9Y5J7 89 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 LHFPL6Q9Y693 200 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa3.96□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 SHANK1Q9Y566 2161 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa3.95□□□□□ -1.78
TRDN-204ENST00000542443 OR6C6A6NF89 314 aa3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.7 ms