RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516584.1

RNU6-1004P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1004, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1004P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PYCR3Q53H96 274 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 DNLZQ5SXM8 178 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NOXRED1Q6NXP6 359 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SDIM1Q6ZPB5 146 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FAM172AQ8WUF8 416 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP2.86□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UPK3BQ9BT76 320 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TMEM147Q9BVK8 224 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C11orf1Q9H5F2 150 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa2.86□□□□□ -1.95
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 C19orf71A6NCJ1 209 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GGTLC3B5MD39 225 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PLA2G10O15496 165 aa2.85□□□□□ -1.95
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 SPATA12Q7Z6I5 190 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR52L1Q8NGH7 329 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 FNDC9Q8TBE3 224 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ROPN1LQ96C74 230 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 DUSP21Q9H596 190 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 TRIP11Q15643 1979 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A0A0J9YY10 115 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A0A1B0GX78 115 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LRCOL1A6NCL2 159 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR11H12B2RN74 326 aa2.84□□□□□ -1.95
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CCL3P10147 92 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CRHBPP24387 322 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GABRA2P47869 451 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RAB13P51153 203 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RAB14P61106 215 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP2.84□□□□□ -1.95
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 LGALS9CQ6DKI2 356 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ZFAND6Q6FIF0 208 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OOSP2Q86WS3 158 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 LYPD6Q86Y78 171 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 OR11H2Q8NH07 326 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 TSPAN32Q96QS1 320 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 COMMD5Q9GZQ3 224 aa2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MYO10Q9HD67 2058 aa2.84□□□□□ -1.95
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 DHRS12A0PJE2 317 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1004P-201ENST00000516584 C2orf74A8MZ97 194 aa2.83□□□□□ -1.96
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 SMARCD3Q6STE5 483 aa2.83□□□□□ -1.96
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 TBC1D19Q8N5T2 526 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1004P-201ENST00000516584 GDPD1Q8N9F7 314 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1004P-201ENST00000516584 Q8NAQ8 132 aa2.83□□□□□ -1.96
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 CT55Q8WUE5 264 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MND1Q9BWT6 205 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1004P-201ENST00000516584 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 SMDT1Q9H4I9 107 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CYTL1Q9NRR1 136 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1004P-201ENST00000516584 CISHQ9NSE2 258 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ASF1BQ9NVP2 202 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1004P-201ENST00000516584 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1004P-201ENST00000516584 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
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RNU6-1004P-201ENST00000516584 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1004P-201ENST00000516584 HECW2Q9P2P5 1572 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A0A087WUU8 490 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-1004P-201ENST00000516584 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-1004P-201ENST00000516584 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-1004P-201ENST00000516584 A0A1W2PQ67 120 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-1004P-201ENST00000516584 I3L521 148 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-1004P-201ENST00000516584 PIRO00625 290 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-1004P-201ENST00000516584 ATG12O94817 140 aa2.82□□□□□ -1.96
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