RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481220.5

SNHG12-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, human

TSL 3

Gene SNHG12, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG12-208	ENST00000481220	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		14	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	ARPC4	P59998	168 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	MSMO1	Q15800	293 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		13.99	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220		A0A0G2JLM5	398 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	PPY	P01298	95 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	FCER2	P06734	321 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	APELA	P0DMC3	54 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	CBX5	P45973	191 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	TNXA	Q16473	311 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	OR2B11	Q5JQS5	317 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	GPHA2	Q96T91	129 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		13.98	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	NCS1	P62166	190 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	DYRK1A	Q13627	763 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	OR4S2	Q8NH73	311 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	SAP30	O75446	220 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	OR9G9	P0C7N8	305 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	TAS2R20	P59543	309 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	DEFA5	Q01523	94 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	CD69	Q07108	199 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	MMD2	Q8IY49	270 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	USMG5	Q96IX5	58 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	PHB2	Q99623	299 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SNHG12-208	ENST00000481220	TENM3	Q9P273	2699 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220		A0A1B0GW64	132 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220		E7EUB6	86 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	TNFSF12	O43508	249 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	KBTBD11	O94819	623 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	OR2A4	O95047	310 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	NAT1	P18440	290 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	VBP1	P61758	197 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	ZNF45	Q02386	682 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	OR2A7	Q96R45	310 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	SPIN2A	Q99865	258 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	COA4	Q9NYJ1	87 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	TEX22	C9J3V5	150 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	TRBV12-3	P01733	135 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	SMIM18	P0DKX4	95 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	IL34	Q6ZMJ4	242 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	SORL1	Q92673	2214 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	RBFOX2	O43251	390 aa	Known RBP eCLIP	13.93	□□□□□ -0.18	3e-7	■■■■□ 24.9
SNHG12-208	ENST00000481220	PRH1	P02810	166 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	SPN	P16150	400 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	ZP3	P21754	424 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	GNRHR	P30968	328 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	KIR2DS2	P43631	304 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	RFX2	P48378	723 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	CMTM3	Q96MX0	182 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		13.93	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	ACTL6B	O94805	426 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	MAS1L	P35410	378 aa		13.92	□□□□□ -0.18
SNHG12-208	ENST00000481220	FXYD4	P59646	89 aa		13.92	□□□□□ -0.18

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