RNA–Protein interactions for RNA: YKR063C

LAS1, Transcript of Protein required for pre-rRNA processing at both ends of ITS2, yeast

Gene LAS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LAS1	YKR063C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	THI6	P41835	540 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
LAS1	YKR063C	YGR237C	P50089	785 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	YGR117C	P53270	476 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	SOL4	P53315	255 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	MFM1	Q02783	413 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	OPI10	Q08202	246 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	TMA16	Q08687	178 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	SMC6	Q12749	1114 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	CBP1	P07252	654 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	OM45	P16547	393 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	PHO13	P19881	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	SBA1	P28707	216 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	CAB3	P36076	571 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	PET10	P36139	283 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	VBA5	P36172	582 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	CTM1	P38818	585 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	OSW7	P43611	510 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	CBK1	P53894	756 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	ADY3	Q07732	790 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	PSO2	P30620	661 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	SRP101	P32916	621 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	YET1	P35723	206 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	SUL1	P38359	859 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	GAA1	P39012	614 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	PLB1	P39105	664 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	TCB2	P48231	1178 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	FMS1	P50264	508 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	VPS60	Q03390	229 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	AIM33	Q04516	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	SVF1	Q05515	481 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	ADY4	Q05955	493 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	SUE1	Q06524	206 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	CDA1	Q06702	301 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	YLL058W	Q12198	575 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	SEC65	P29478	273 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	POA1	P38218	177 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	EFM2	P38347	419 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	CAJ1	P39101	391 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	VAC8	P39968	578 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	ACA1	P39970	489 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	MET12	P46151	657 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	ALF1	P53904	254 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	SFB2	P53953	876 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	SEC5	P89102	971 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	YLR287C	Q05881	355 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	VPS38	Q05919	439 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	SFI1	Q12369	946 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	SPO11	P23179	398 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	ERG7	P38604	731 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	TCD1	P38756	429 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	RTT107	P38850	1070 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	CEP3	P40969	608 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	YGR012W	P53206	393 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	ALD6	P54115	500 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	YAP7	Q08182	245 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	APL4	Q12028	832 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	ATG9	Q12142	997 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	PET123	P17558	318 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	RPC53	P25441	422 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	FUN30	P31380	1131 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	PCH2	P38126	564 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	PPS1	P38148	807 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	SIP3	P38717	1229 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	YEL076C	P39971	216 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	NUP82	P40368	713 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	SMC3	P47037	1230 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	PGA2	P53903	129 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	YML037C	Q03703	340 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	COG4	Q06096	861 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	SPO75	Q07798	868 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	PLP2	Q12017	286 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	CSR2	Q12734	1121 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	HIS5	P07172	385 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	PET111	P08468	800 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LAS1	YKR063C	RAD18	P10862	487 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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