RNA–Protein interactions for RNA: YJL134W

LCB3, Transcript of Long-chain base-1-phosphate phosphatase, yeastyeast

Gene LCB3, Length 1,230 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB3YJL134W IVY1Q04934 453 aa6.6□□□□□ -1.35
LCB3YJL134W YLR455WQ06188 304 aa6.6□□□□□ -1.35
LCB3YJL134W YOR223WQ12015 292 aa6.6□□□□□ -1.35
LCB3YJL134W SUT2Q12286 268 aa6.6□□□□□ -1.35
LCB3YJL134W YOR131CQ12486 218 aa6.6□□□□□ -1.35
LCB3YJL134W SEY1Q99287 776 aa6.6□□□□□ -1.35
LCB3YJL134W MOT1P32333 1867 aa6.6□□□□□ -1.35
LCB3YJL134W GAL10P04397 699 aa6.59□□□□□ -1.35
LCB3YJL134W CYT1P07143 309 aa6.59□□□□□ -1.35
LCB3YJL134W ADH4P10127 382 aa6.59□□□□□ -1.35
LCB3YJL134W KAR3P17119 729 aa6.59□□□□□ -1.35
LCB3YJL134W CLB1P24868 471 aa6.59□□□□□ -1.35
LCB3YJL134W EFB1P32471 206 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
LCB3YJL134W UIP5P36137 443 aa6.59□□□□□ -1.35
LCB3YJL134W PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data6.59□□□□□ -1.35not detected
LCB3YJL134W VHC1P38329 1120 aa6.59□□□□□ -1.35
LCB3YJL134W SAP30P38429 201 aa6.59□□□□□ -1.35
LCB3YJL134W APM2P38700 605 aa6.59□□□□□ -1.35
LCB3YJL134W SAH1P39954 449 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
LCB3YJL134W RAD26P40352 1085 aa6.59□□□□□ -1.35
LCB3YJL134W ASG1P40467 964 aa6.59□□□□□ -1.35
LCB3YJL134W PXA1P41909 870 aa6.59□□□□□ -1.35
LCB3YJL134W INP52P50942 1183 aa6.59□□□□□ -1.35
LCB3YJL134W YML6P51998 286 aa6.59□□□□□ -1.35
LCB3YJL134W HOP2P53187 214 aa6.59□□□□□ -1.35
LCB3YJL134W CPR6P53691 371 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
LCB3YJL134W MSC2Q03455 724 aa6.59□□□□□ -1.35
LCB3YJL134W YOR059CQ08448 450 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
LCB3YJL134W ADE3P07245 946 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W HEM1P09950 548 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W POL3P15436 1097 aa6.58□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W MSS51P32335 436 aa6.58□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W YME1P32795 747 aa6.58□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W CCL1P37366 393 aa6.58□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W PCA1P38360 1216 aa6.58□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W TMN3P40071 706 aa6.58□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W YMR134WP40207 237 aa6.58□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W SAD1P43589 448 aa6.58□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W YGL140CP53120 1219 aa6.58□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W GPD1Q00055 391 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W JIP5Q06214 492 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W ACM1Q08981 209 aa6.58□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W ATG11Q12527 1178 aa6.58□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W TAO3P40468 2376 aa6.58□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W BI2P03873 423 aa6.57□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W BI4P03879 638 aa6.57□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W SFL1P20134 766 aa6.57□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W PUF4P25339 888 aaKnown RBP RIP-Chip data6.57□□□□□ -1.36not detected
LCB3YJL134W ILV6P25605 309 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W PRR1P28708 518 aa6.57□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W GPI10P30777 616 aa6.57□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W POP4P38336 279 aa6.57□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W YHR054CP38780 354 aa6.57□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W TRS85P46944 698 aa6.57□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W URB2P47108 1174 aa6.57□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W YJR054WP47114 497 aa6.57□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W ALT1P52893 592 aa6.57□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W YGL036WP53185 909 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W CUS1Q02554 436 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W BI3Q9ZZW7 517 aa6.57□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W LAA1P39526 2014 aa6.56□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W JIP3O13555 125 aa6.56□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W COX4P04037 155 aa6.56□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W MOD5P07884 428 aa6.56□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W RPB2P08518 1224 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W TUB3P09734 445 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W PYC1P11154 1178 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W GLN3P18494 730 aa6.56□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W ADE2P21264 571 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W SEC1P30619 724 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W SQT1P35184 431 aa6.56□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W OAF3P36023 863 aa6.56□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W NOP4P37838 685 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W PCM1P38628 557 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W QNS1P38795 714 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W SMX2P40204 77 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W KHA1P40309 873 aa6.56□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W SKP2P42843 763 aa6.56□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W RGD2P43556 714 aa6.56□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W LAM5P43560 674 aa6.56□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W PUS2P53167 370 aa6.56□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W ALG11P53954 548 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W DAK1P54838 584 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W SHR3Q02774 210 aa6.56□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W ARO80Q04052 950 aa6.56□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W SXM1Q04175 944 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W PUS1Q12211 544 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W YPR015CQ12531 247 aa6.56□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W RIF1P29539 1916 aa6.56□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W ADE4P04046 510 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W PEP5P12868 1029 aa6.55□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W AEP2P22136 580 aa6.55□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W RPT1P33299 467 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W YMC2P38087 329 aa6.55□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W TBS1P38114 1094 aa6.55□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W GEM1P39722 662 aa6.55□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W RPT2P40327 437 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W DSN1P40568 576 aa6.55□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W SNZ3P43545 298 aa6.55□□□□□ -1.36
LCB3YJL134W ZAP1P47043 880 aa6.55□□□□□ -1.36
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